将MPI更新到最新版本

Question

我想将我的MPI升级到最新的稳定版本，即版本2.0.1。在我自己检查之前，我检查了Open MPI site上是否有用的东西。

FAQ page上的第6点明确表示安装一个版本的Open MPI不会卸载另一个版本。要安装较新版本，该网站建议采用以下四种方式之一。

• 将较新版本的Open MPI安装到其他目​​录。我不想安装这两个版本。
• 构建树中的make卸载过程应该从安装树中完全卸载该版本，从而可以安全地将新版本安装到同一个安装树中。我不认为我有构建树（也不是源树;也许我按照this之类的指南删除了这些文件夹），所以我没有make unistall命令来运行。
• 完全删除旧安装目录，然后安装新版本。这是我唯一可以做的事情，因为......
• ...不推荐第四种方式，所以我会避免它。

现在重点是如何找到安装目录？如果我locate mpirun或mpifort我在多个文件夹中找到了一些结果，其中很多都不是.../openmpi/...。

编辑：我真的对Ubuntu 15.10和Mac OS X 10.11.6的这个问题的答案感兴趣。

Answer 1

我知道这是一个古老的问题，但是我想发布一个答案，以备将来参考。在常见问题解答的第四点中，在介绍了不推荐的方法之后，他们指出以下内容：

实际上，如果您不再有权访问原始的Open MPI abc源并构建树，则从Open MPI网站再次下载Open MPI版本abc，并使用相同的安装前缀对其进行配置，可能要简单得多。然后运行make uninstall。或使用上述其他方法之一。

Answer 2

如果您想要安装最新的OpenMPI，而不卸载当前的OpenMPI，只需将其安装在您想要的任何目录中即可。例如，如果您将其安装在家中的bin文件夹中，则执行以下操作：

$ configure --prefix=/home/bin <any_OpenMPI_options>

$ make all install

然后，每当您想要使用这个新版本时，您必须选择：

1. 只要您使用mpicc或mpirun，就可以指定二进制文件的完整路径。例如：

   $ /home/bin/mpicc ...

   $ /home/bin/mpirun ...

2. 另一个选项是将/home/bin路径（新的OpenMPI可执行文件所在的路径）添加到PATH环境变量中。当然，请记住将lib文件夹添加到/home/bin/lib和LD_LIBRARY_PATH {/ 1}}。