在R包

Question

在编写R包时，加载动态链接库（即.so文件）的正确方法是什么？到目前为止，唯一对我有用的解决方案是指定.so文件的完整路径，例如：

dyn.load('/FULL/PATH/TO/MY/R_PACKAGE/src/my_file.so')

显然，这种方法不适用于CRAN / Bioconductor提交，因为找不到.so文件。因此，我（尝试失败）尝试了以下替代方案：

1）library.dynam()

2）library.dynam('my_file.so')

3）library.dynam('my_file.so', 'R_PACKAGE')

4）system.file("src", "my_file.so", package = "R_PACKAGE")

相关链接：R: C symbol not in load table，R: C symbol name not in load table - error in linking with external .c files。

为了清楚起见，我的R包的用户显然可以在他们的计算机上设置任意工作目录。完整路径方法（如上所示）可行的唯一方法是将工作目录设置为/FULL/PATH/TO/MY/R_PACKAGE/src，这当然是不切实际的。

Answer 1

Writing R Extensions中描述的标准方法是：

  

1.5.4 useDynLib

     

NAMESPACE文件可以包含一个或多个useDynLib指令，这些指令允许需要加载的共享对象。*指令

     

useDynLib(foo)

     

注册共享对象foo **以加载library.dynam。在加载包代码之后和运行加载挂钩功能之前，加载已注册的对象。只需要加载钩子函数来加载共享对象的包可以使用useDynLib指令。

     

*注意：如果软件包在R目录中包含R代码，则只能在所有版本的R中读取。   **请注意，这是共享对象的基本名称，并且将添加适当的扩展名（.so或.dll）。

Answer 2

快点：

• 为什么需要发送.so个文件？这将阻止上传到CRAN这样的公共存储库，它不接受二进制内容

• 您可以使用/FULL/PATH/TO/MY/R_PACKAGE/src/my_file.so计算完整system.file("src", "my_file.so", package="R_PACKAGE")（但请务必确保实际安装的src/不是标准的）

• 在所有其他情况（正如@BenBolker所指出的）R将知道如何创建动态库并为您加载它。每个包含编译代码的包都可以。只需将源代码放入src/即可（基本上）完成。