我在阅读csv
文件时遇到错误。该行的前几行如下:
"","1.CEL","2.CEL","3.CEL","4.CEL"
"1_s_at",NA,NA,NA,NA
"2_at",NA,NA,NA,NA
"3_at",NA,NA,NA,NA
"4_at",NA,NA,NA,NA
"5_g_at",NA,NA,NA,NA
"6_at",NA,NA,NA,NA
"7_at",NA,NA,NA,NA
阅读csv.file
test <- read.csv(file='/home/userxyz/test.csv')
head(test)
# X X1.CEL X2.CEL X3.CEL X4.CEL
#1 1_s_at NA NA NA NA
#2 2_at NA NA NA NA
#3 3_at NA NA NA NA
#4 4_at NA NA NA NA
#5 5_g_at NA NA NA NA
#6 6_at NA NA NA NA
明确指定标题的存在。
test <- read.csv(file='/home/userxyz/test.file', header=T)
head(test)
# X X1.CEL X2.CEL X3.CEL X4.CEL
#1 1_s_at NA NA NA NA
#2 2_at NA NA NA NA
#3 3_at NA NA NA NA
#4 4_at NA NA NA NA
#5 5_g_at NA NA NA NA
#6 6_at NA NA NA NA
虽然明确指定了row.names,但它不起作用。
test <- read.csv(file='/home/userxyz/test.file', row.names=T)
#Error in read.table(file = file, header = header, sep = sep, quote = quote, :
# invalid 'row.names' specification
read.table
,read.delim
函数也被查看过。
错误是因为row.names
?
答案 0 :(得分:1)
我认为您试图在第一列中读取行名称。尝试:
x <- '"","1.CEL","2.CEL","3.CEL","4.CEL"
"1_s_at",NA,NA,NA,NA
"2_at",NA,NA,NA,NA
"3_at",NA,NA,NA,NA
"4_at",NA,NA,NA,NA
"5_g_at",NA,NA,NA,NA
"6_at",NA,NA,NA,NA
"7_at",NA,NA,NA,NA'
read.csv(text = x, row.names = 1L)
# X1.CEL X2.CEL X3.CEL X4.CEL
#1_s_at NA NA NA NA
#2_at NA NA NA NA
#3_at NA NA NA NA
#4_at NA NA NA NA
#5_g_at NA NA NA NA
#6_at NA NA NA NA
#7_at NA NA NA NA
如果要准确保留标题,请执行
read.csv(text = x, row.names = 1L, check.names = FALSE)
# 1.CEL 2.CEL 3.CEL 4.CEL
#1_s_at NA NA NA NA
#2_at NA NA NA NA
#3_at NA NA NA NA
#4_at NA NA NA NA
#5_g_at NA NA NA NA
#6_at NA NA NA NA
#7_at NA NA NA NA
关于row.name
,请阅读?read.csv
:
row.names: a vector of row names. This can be a vector giving the
actual row names, or a single number giving the column of the
table which contains the row names, or character string
giving the name of the table column containing the row names.