Groupby值计入数据帧pandas

时间:2016-08-24 20:45:24

标签: python pandas dataframe crosstab pandas-groupby

我有以下数据框:

df = pd.DataFrame([
    (1, 1, 'term1'),
    (1, 2, 'term2'),
    (1, 1, 'term1'),
    (1, 1, 'term2'),
    (2, 2, 'term3'),
    (2, 3, 'term1'),
    (2, 2, 'term1')
], columns=['id', 'group', 'term'])

我希望按idgroup对其进行分组,并计算此ID,组对的每个字词的数量。

所以最后我会得到这样的东西:

enter image description here

通过使用df.iterrows()循环遍历所有行并创建新数据帧,我能够实现我想要的效果,但这显然效率低下。 (如果有帮助,我事先知道所有术语的列表,其中有10个)。

看起来我必须分组然后计算值,所以我尝试使用df.groupby(['id', 'group']).value_counts()这不起作用,因为value_counts对groupby系列而不是数据帧进行操作。

无论如何,我可以在没有循环的情况下实现这一目标吗?

4 个答案:

答案 0 :(得分:54)

我使用groupbysize

df.groupby(['id', 'group', 'term']).size().unstack(fill_value=0)

enter image description here

时序

enter image description here

1,000,000行

df = pd.DataFrame(dict(id=np.random.choice(100, 1000000),
                       group=np.random.choice(20, 1000000),
                       term=np.random.choice(10, 1000000)))

enter image description here

答案 1 :(得分:10)

使用pivot_table()方法:

In [22]: df.pivot_table(index=['id','group'], columns='term', aggfunc='size', fill_value=0)
Out[22]:
term      term1  term2  term3
id group
1  1          2      1      0
   2          0      1      0
2  2          1      0      1
   3          1      0      0

针对700K行的时间DF:

In [24]: df = pd.concat([df] * 10**5, ignore_index=True)

In [25]: df.shape
Out[25]: (700000, 3)

In [3]: %timeit df.groupby(['id', 'group', 'term'])['term'].size().unstack(fill_value=0)
1 loop, best of 3: 226 ms per loop

In [4]: %timeit df.pivot_table(index=['id','group'], columns='term', aggfunc='size', fill_value=0)
1 loop, best of 3: 236 ms per loop

In [5]: %timeit pd.crosstab([df.id, df.group], df.term)
1 loop, best of 3: 355 ms per loop

In [6]: %timeit df.groupby(['id','group','term'])['term'].size().unstack().fillna(0).astype(int)
1 loop, best of 3: 232 ms per loop

In [7]: %timeit df.groupby(['id', 'group', 'term']).size().unstack(fill_value=0)
1 loop, best of 3: 231 ms per loop

针对7M行的时间DF:

In [9]: df = pd.concat([df] * 10, ignore_index=True)

In [10]: df.shape
Out[10]: (7000000, 3)

In [11]: %timeit df.groupby(['id', 'group', 'term'])['term'].size().unstack(fill_value=0)
1 loop, best of 3: 2.27 s per loop

In [12]: %timeit df.pivot_table(index=['id','group'], columns='term', aggfunc='size', fill_value=0)
1 loop, best of 3: 2.3 s per loop

In [13]: %timeit pd.crosstab([df.id, df.group], df.term)
1 loop, best of 3: 3.37 s per loop

In [14]: %timeit df.groupby(['id','group','term'])['term'].size().unstack().fillna(0).astype(int)
1 loop, best of 3: 2.28 s per loop

In [15]: %timeit df.groupby(['id', 'group', 'term']).size().unstack(fill_value=0)
1 loop, best of 3: 1.89 s per loop

答案 2 :(得分:7)

而不是记住冗长的解决方案,熊猫为你建造的那个怎么样:

df.groupby(['id', 'group', 'term']).count()

答案 3 :(得分:5)

您可以使用crosstab

df = pd.concat([df]*10000).reset_index(drop=True)

In [48]: %timeit (df.groupby(['id', 'group', 'term']).size().unstack(fill_value=0))
100 loops, best of 3: 12.4 ms per loop

In [49]: %timeit (df.groupby(['id', 'group', 'term'])['term'].size().unstack(fill_value=0))
100 loops, best of 3: 12.2 ms per loop

另一个groupby聚合size的解决方案,按unstack重新整形:

df = df.sum(axis=0)   

<强>计时

            SplashScr splash = new SplashScr ();
            splash.setVisible(true);
            MainFrame mainFrame = new MainFrame();

            SwingWorker<Void, Void> worker = new SwingWorker<Void, Void>() {
                @Override
                protected Void doInBackground() throws Exception {
                    Thread.sleep(2000);
                    return null;
                }

                protected void done() {
                    splash.setVisible(false);
                    mainFrame.setVisible(true);
                    splash.dispose();
                    mainFrame.startProcess(args);
                }
            };
            worker.execute();