看似简单的rpubchem交互功能会产生错误

时间:2016-08-23 21:55:22

标签: r pubchem

以下R代码行以斜体显示错误。这似乎是一个rpubchem错误,除非我做一些愚蠢的事情:

    require(rpubchem);
    get.aid.by.cid(614467, type="raw")

输出:

***Warning messages:
1: In readLines(icon, n = 100) :
  seek on a gzfile connection returned an internal error
2: In readLines(icon, n = 100) :
  seek on a gzfile connection returned an internal error
3: In file.remove(iname) :
  cannot remove file 'C:\Users\bkoch\AppData\Local\Temp\RtmpSs77GM\abycbdc276782.gz', reason 'Permission denied'***

任何人都知道这里发生了什么?

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

警告中提到的文件夹是在通过此包提取数据期间创建的临时文件。警告提到的文件名存在,但缺少.gz扩展名,这可能是问题的一部分。

我通过运行代码并检查文件来验证这一点。显然这个问题是一个小错误,我建议在GitHub上提交错误报告。

但是请注意,它只是警告而不是错误,而且功能似乎仍然有效。