Question

我有这样的Range类的代码：

class Range:
   def __init__(self, start, end):
      self.setStart(start)
      self.setEnd(end)
   def getStart(self):
      return self.start
   def setStart(self, s):
      self.start = s
   def getEnd(self):
      return self.end
   def setEnd(self, e):
      self.end = e
   def getLength(self):
      return len(range(self.start, self.end))
   def overlaps(self, r):
      if (r.getStart() < self.getEnd() and r.getEnd() >= self.getEnd()) or \
         (self.getStart() < r.getEnd() and self.getEnd() >= r.getEnd()) or \
         (self.getStart() >= r.getStart() and self.getEnd() <= r.getEnd()) or \
         (r.getStart() >= self.getStart() and r.getEnd() <= self.getEnd()):
          return True
      else:
          return False

我的任务是创建一个名为DNAFeature的Range子类，它表示一个也有一个strand和一个序列名称的Range：

实施设置和返回链信息的setStrand和getStrand，以及setSeqName和getSeqName，它们设置或返回要素所属序列的名称。如果某个要素位于减（反向）链上，getStrand()应返回-1。如果要素位于正链上，则getStrand()应返回1.如果未设置strand，则getStrand()应返回0.

我曾尝试写过一些东西，但对我来说看起来并不合适，大家可以帮我解决这个问题，非常感谢你们，这是我的代码：

class DNAFeature(Range):
    def __init__(self, strand, sequence):
            self.setStrand(strand)
            self.setSeqName(sequence)
    def getSeqName(self):
            return self.plus or minus
    def setSeqName(self, seq):
            self.sequence = seq
    def getStrand(self):
            if self.getSeqName(self.strand) == 'plus':
                    return 1
            if self.getSeqName(self.strand) == 'minus':
                    return -1
            else:
                    return 0
    def setStrand(self, strand):
            self.strand = strand

Answer 1

一般来说，如果您提供特定错误消息或出错的事情，则回答问题要容易得多。以下是我试图运行上述内容时发生的事情：

首先：
```
`SyntaxError: invalid syntax` 
```
<{1>} if seq == POSITIVE。这有什么不对？哦，是的，你在条件之后错过了冒号。如果你添加该文件至少解析。所以让我们尝试做一些编码：
```
# Your code here, then:
feature = DNAFeature()
```
跑步给出：
```
TypeError: __init__() takes exactly 3 positional arguments (1 given)
```
哦，好的，我们需要将一些参数传递给DNAFeature的初始化器。让我们把它放在+链上，并称之为foo：
```
feature = DNAFeature(1, "foo")
```
现在我们得到：
```
AttributeError: 'DNAFeature' object has no attribute 'setStrand'
```
那是什么意思？好的，你还没有定义setStrand。（注意：你不应该这样做。但稍后会更多。）让我们来定义它：
```
def setStrand(self, strand):
    self.strand = strand
```

我不想解决代码中的其他问题（提示：你需要在使用之前定义变量），但这是你应该做的事情。

对，不同的东西。 以上是错误的代码。我希望你已经编写了Range课程并且它没有被提供作为课程的一部分，因为如果你的课程很糟糕 - 当然。主要的问题是使用getter和setter - 我猜你是Java出生和繁殖的？在Python中，您不需要为所有内容编写getter和setter，因为如果需要，您可以随后添加它们。相反，只需使用类属性。请查看Range的以下代码：

class Range:
    def __init__(self, start, end):
        self.start = start
        self.end = end

    def length(self):
        return self.end - self.start

    def overlaps(self, other):
        return not(self.end < other.start or other.end < self.start)

那不是更好吗？没有更讨厌的访问器，overlaps方法中没有任何比较...如果您在实现代码之前尝试实现的逻辑，它会有所帮助。

看看你现在是否可以写出更好的DNAFeature。

你仍然没有告诉我getStrand应该做什么，但是这就是我认为你的目标。假设传递给__init__的链名称的格式为"+name"或"-name"。然后，您可以执行以下操作：

def __init__(self, strand):
    sequence = strand[0] #first character of strand

    if sequence == "+":
        self.strand = 1
        self.sequence= strand[1:]
    elif sequence == "-":
        self.strand = -1
        self.sequence = strand[1:]
    else:
        self.strand = 0
        self.sequence = strand

看看你是否能弄清楚它是如何运作的。

Answer 2

在最通用的情况下（没有做出任何假设），似乎这就是你所需要的：

class DNAFeature(Range):

    def __init__(self, start, end):
        self.setStart(start)
        self.setEnd(end)
        self.strand = None
        self.sequencename = None

    def setStrand(self, s):
        self.strand = s

    def getStrand(self):
        if self.sequenceName == 'plus':
            return 1
        elif self.sequenceName == 'minus':
            return -1
        else:
            return 0

    def setSequenceName(self, s):
        self.sequencename = s

    def getSequenceName(self, s):
        return self.sequenceName

您会注意到，我已重新定义 init 。有一个原因。我记得在你之前的一个问题中，你提到过这是一个Java任务，只是重命名为python。在Java中，构造函数不是继承的（如果我错了，请纠正我）。因此，如果使用相同的评分量规，则不会在此处重新定义构造函数而丢失标记。

希望这有帮助

Python Range Class / Subclass

2 个答案: