Question

我正在使用Cython的打包安装运行Debian 8（apt-get install cython）。

我正在使用CGAL（www.cgal.org）编译我的.pyx文件，但是返回错误：

import pyximport; pyximport.install()
from spaces import spaces_rectangle

ImportError：构建模块空间失败：['ImportError： /home/scootie/.pyxbld/lib.linux-x86_64-2.7/spaces.so：未定义的符号： __gmpq_equal \ N']

包含以下文件：

spaces.pyx

from libcpp.vector cimport vector

cdef extern from "cgal_spaces.hpp":
    cdef vector[vector[vector[double]]] wrap_spaces(vector[vector[double]])

def spaces_rectangle(vector[vector[double]] rect):
    return wrap_spaces(rect)

spaces.pyxbld：

def make_ext(modname, pyxfilename):
    from distutils.extension import Extension
    return Extension(name=modname,
                     sources=[pyxfilename],
                     include_dirs=['.'],
                     libraries=['CGAL'],
                     language='c++',
                     extra_compile_args=['-std=c++11'])

和cgal_spaces.hpp：

#include <CGAL/Exact_predicates_inexact_constructions_kernel.h>
#include <CGAL/Partition_traits_2.h>
#include <CGAL/Partition_is_valid_traits_2.h>
#include <CGAL/polygon_function_objects.h>
#include <CGAL/partition_2.h>
#include <cassert>
#include <list>
#include <vector>
{
    *CODE HERE*
}

我是不正确地连接还是遗漏了一些明显的东西？

编辑：如果我在pyximport之外编译脚本，它编译没有问题。

cython -a spaces.pyx
g++ -std=c++11 -shared -pthread -fPIC -fwrapv -O2 -Wall -fno-strict-aliasing -I/usr/include/python2.7 -o spaces.so spaces.c

似乎pyximport与gmp库存在链接错误。链接到所有外部库的正确方法是什么？

Answer 1

解决方案：

def make_ext(modname, pyxfilename):
    from distutils.extension import Extension
    return Extension(name=modname,
                 sources=[pyxfilename],
                 include_dirs=['.'],
                 libraries=['CGAL','gmp'],
                 language='c++',
         extra_compile_args=['-std=c++11','-DCGAL_ROOT="/path/to/CGAL-4.8.1"'])

我已将gmp库添加到* .pyxbld，但解决方案是将-DCGAL_ROOT放在“-std = c ++ 11”之后。

Answer 2

库中可能缺少gmp库，

strings -f /usr/lib/x86_64-linux-gnu/*.a |grep gmpq_equal

输出

/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libgmp.a: __gmpq_equal
/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libgmp.a: __gmpq_equal

pyximport与cgal构建错误：未定义的符号“__gmpq_equal”

2 个答案: