CUDA histogram2d无效

时间:2016-08-19 03:38:15

标签: python numpy cuda pycuda histogram2d

由于看似缺乏适合CUDA的2D直方图(我可以找到...指针欢迎),我正在尝试用pyCUDA自己实现它。

这是直方图的样子(使用Numpy):

Numpy Histogram

这是我到目前为止所得到的:

code = '''
__global__ void histogram2d(const float *in_x, const float *in_y, const float *in_w, float *out) {{
    int start = blockIdx.x * blockDim.x + threadIdx.x;

    float *block_out = &out[{xres} * {yres} * {num_chans} * blockIdx.x];

    for(int i = 0; i < {length}; i++) {{
        float x = in_x[start + i];
        float y = in_y[start + i];
        int w_idx = (start + i) * {num_chans};

        int xbin = (int) (((x - {xmin}) / {xptp}) * {xres});
        int ybin = (int) (((y - {ymin}) / {yptp}) * {yres});

        if (0 <= xbin && xbin < {xres} && 0 <= ybin && ybin < {yres}) {{
            for(int c = 0; c < {num_chans}; c++) {{
                atomicAdd(&block_out[(ybin * {xres} + xbin) * {num_chans} + c], in_w[w_idx + c]);
            }}
        }}
    }}
}}
'''.format(**args)

------

__global__ void histogram2d(const float *in_x, const float *in_y, const float *in_w, float *out) {
    int start = blockIdx.x * blockDim.x + threadIdx.x;

    float *block_out = &out[50 * 50 * 4 * blockIdx.x];

    for(int i = 0; i < 100; i++) {
        float x = in_x[start + i];
        float y = in_y[start + i];
        int w_idx = (start + i) * 4;

        int xbin = (int) (((x - -10.0) / 20.0) * 50);
        int ybin = (int) (((y - -10.0) / 20.0) * 50);

        if (0 <= xbin && xbin < 50 && 0 <= ybin && ybin < 50) {
            for(int c = 0; c < 4; c++) {
                atomicAdd(&block_out[(ybin * 50 + xbin) * 4 + c], in_w[w_idx + c]);
            }
        }
    }
}

CUDA histogram

索引似乎有问题,但之前我没有做过很多纯粹的CUDA,所以我不知道它是什么。这就是我认为等效的python:

def slow_hist(in_x, in_y, in_w, out, blockx, blockdimx, threadx):
    start = blockx * blockdimx + threadx

    block_out_addr = args['xres'] * args['yres'], args['num_chans'] * blockx

    for i in range(args['length']):
        x = in_x[start + i]
        y = in_y[start + i]
        w_idx = (start + i) * args['num_chans']

        xbin = int(((x - args['xmin']) / args['xptp']) * args['xres'])
        ybin = int(((y - args['ymin']) / args['yptp']) * args['yres'])

        if 0 <= xbin < args['xres'] and 0 <= ybin < args['yres']:
            for c in range(args['num_chans']):
                out[(ybin * args['xres'] + xbin) * args['num_chans'] + c] += in_w[w_idx + c]

Pure-python histogram

所有代码都是可见的,包括这些图像,at the Github page of this notebook(此单元格位于底部)。

我在这个CUDA代码中做错了什么?我已经尝试了很多小的调整(通过1,4,8,16转换atomicAdd地址,转置输出等),但似乎我遗漏了一些微妙的东西,可能是指针算法是如何工作的。任何帮助将不胜感激。

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

为CUDA部分的输出数组分配的数组使用Numpy的默认float64而不是float32,因此内存是预期的两倍。这是新的直方图输出:

New CUDA histogram

我仍然非常感谢有助于解释为什么这些直方图彼此如此不同的评论或答案。