Question

我是使用imageJ并创建自己的代码的新手，无论如何，我正在尝试创建一个同时运行所有roi的循环，但我无法做到这一点。到目前为止，这是我的代码：

input = "S:\\Research Projects\\BAC\\machine training set\\Results_1stRound\\2016Data_1stRound\\epoch_based_training_0.7_TPF=0.615_FP=2.110\\SID130871_9999.330357336093230241152104825447607218951\\"; 
output = input; 

function action(input, output, filename) { 
open(input + filename); 
setThreshold(112, 255); 
run("Create Selection"); 

roiManager("Add"); 
roiManager("Select", 0); 
saveAs("selection", output + filename); 
close(); 
roiManager("Deselect"); 
roiManager("Delete"); 
} 

list = getFileList(input); 
for (i = 0; i < list.length; i++) 
        action(input, output, list[i]);

我想要循环做的是查看我拥有的所有不同的SID文件，所以我不需要输入中的特定SID部分，但我不知道如何创建一个循环以便它通过文件夹（SID文件）和子文件夹来创建rois。截至目前，我必须将特定的SID文件放在输入中，因此任何有关如何创建循环以查看不同SID文件然后创建rois的帮助都会很棒。

Answer 1

您可以在ImageJ邮件列表存档中找到一些宏示例和示例，如何迭代嵌套文件夹：

https://imagej.nih.gov/ij/macros/BatchProcessFolders.txt

http://imagej.1557.x6.nabble.com/batch-process-macro-td4469342.html

ImageJ：帮助创建一个浏览文件夹和子文件夹的LOOP

1 个答案: