使用awk在匹配后加入行

Question

我有一个如下所示的列表：

>aaa(+)
AAAAAAAAAA
>bbb(+)
BBBBBBBBBBBBBBBB
>ccc(-)
CCCCCCC

我希望在＆＃39;（+）＆＃39;之后使用awk加入下一行。或者＆＃39;（ - ）＆＃39;，用逗号分隔符，使它看起来像这样：

>aaa(+),AAAAAAAAAAA
>bbb(+),BBBBBBBBBBBBBBBB
>ccc(-),CCCCCCC

我已经尝试了以下（在bash中）：

cat $file | awk '/(-)/||/(+)/{if (x)print x;x"";}{x=(!x)?$0:x","$0;}END{print x;}' > $new_file

但这似乎给出了这样的结果：

>aaa(+),AAAAAAAAAAA
>aaa(+),AAAAAAAAAAA,>bbb(+),BBBBBBBBBBBBBBBB
>aaa(+),AAAAAAAAAAA,>bbb(+),BBBBBBBBBBBBBBBB,>ccc(-),CCCCCCC

这显然不是我想做的事。

非常感谢任何帮助！

由于

Answer 1

这个awk单行应该适用于你的例子：

awk '/^>/{printf "%s,",$0;next}7' file

它以>开头的行与其下面的行连接。如果(+/-)是关键，您可以将模式更改为您感兴趣的密钥。

Answer 2

使用gnu awk你也可以这样做：

$ awk -v RS=">"  '$0 != ""{ printf ">%s",gensub(/\)\n/,"),","g")}' file
>aaa(+),AAAAAAAAAA
>bbb(+),BBBBBBBBBBBBBBBB
>ccc(-),CCCCCCC

Answer 3

paste -d, - - < file

如果您的文件完全由成对的行组成，

粘贴将完成工作，如您的示例所示。