我正在尝试安装R（R版本3.2.4修订版）软件包＆＃39; rgdal＆＃39;在我的Linux上，Ubuntu 14.04，但是当它试图加载依赖项时，包有困难，特别是sqlite。
错误如下：
checking for gdal.h... yes
checking gdal: linking with --libs only... no
checking gdal: linking with --libs and --dep-libs... no
/usr/lib/libgdal.so: undefined reference to `sqlite3_column_table_name'
collect2: error: ld returned 1 exit status
我按照here的说明更新了GDAL / OGR，因为我认为这可能是问题所在。现在，当我在终端输入gdalinfo或ogrinfo时，会出现类似的错误：
gdalinfo: symbol lookup error: /usr/lib/libgdal.so.1: undefined
symbol: sqlite3_column_table_name
当我查看我的usr / local / lib时，会出现以下sqlite库：
libsqlite3.a libsqlite3.la libsqlite3.so libsqlite3.so.0
libsqlite3.so.0.8.6
有趣的是，上周这个套装在R中运行良好，现在已经坏了......
任何帮助表示赞赏！感谢。
-Caitlin
答案 0 :(得分：1)
当我尝试升级GDAL时偶然发现了此错误。解决方法是ENABLE_COLUMN_METADATA，当我配置sqlite进行安装时
sudo CFLAGS="-DSQLITE_ENABLE_COLUMN_METADATA=1" ./configure
有关更多详细信息，请参见sqlite Compile-time options
答案 1 :(得分：0)
听起来像共享库的问题，在不使用包管理器的情况下在系统中安装/更新任何内容？ （我相信它很合适？）
你的系统中的libgdal.so.1是针对某些版本的libsqlite库编译的，现在你更新了其他版本后，已经改变但是libgdal仍然是同一个文件。
我从未使用过Ubuntu，但在Linux中我使用（arch）这是不鼓励部分更新的原因（例如，只更新一个程序）
所以我建议尝试完整的系统更新，或者至少更新sqllite库。