Question

我根据条件填充了一个列表R script并且我生成了一个汇总表但不幸的是，我遇到了表的问题。这是

          id                              Alyr        Crub         Lala
TCONS_00002401.gene=XLOC_001343_TBH_1   Ortholog    Not found   Not found
TCONS_00002401.gene=XLOC_001343_TBH_1   Not found   Not found   Not found
TCONS_00002401.gene=XLOC_001343_TBH_1   Not found   Ortholog    Not found

如您所见，有三行和四列。我所期待的是为所有三个物种（Alyr，Crub和Lala）获得一个想法但不幸的是有三行。我怎么能把这些折叠成这样的东西？

               id                         Alyr        Crub        Lala
TCONS_00002401.gene=XLOC_001343_TBH_1   Ortholog    Ortholog    Not found

Answer 1

可能有一种方法可以过滤掉未映射的直系同源物。

同时，＆＃34;快速和非NotTooDirty＆＃34;解决方案如下：

dcast（子集（融化（df，id =＆＃34; id＆＃34;），值！=＆＃34;未找到＆＃34;），id~variable + value）

其中df是输入数据框对象。

您可能需要重命名列。

第一个表达式（即，熔化（df，id =＆＃34; id＆＃34;）创建一个3列df。子集表达式过滤掉值==＆＃34;未找到＆＃34;的记录。最后，dcast函数将其作为宽数据帧返回，每个id只有一行。

依赖关系：reshape2包（w.r.t.融合和dcast功能）

如何根据R中的查询ID折叠列？

1 个答案: