闪亮:ggplot的动态颜色(填充)输入

时间:2016-08-08 06:51:03

标签: r colors shiny shinyjs

我确实需要一些帮助作为帖子:Dynamic color input in shiny server并没有完全回答我的问题。

我想在我的闪亮应用中选择动态颜色(填充)。我准备了一个示例代码:

library(shiny)
library(shinyjs)
library(reshape2)
library(ggplot2)

dat <- data.frame(matrix(rnorm(60, 2, 3), ncol=3))
dat <- melt(dat)

runApp(shinyApp(
  ui = fluidPage(
    selectizeInput("select","Select:", choices=as.list(levels(dat$variable)), selected="X1",multiple =TRUE),
    uiOutput('myPanel'),
    plotOutput("plot"),
    downloadButton('downloadplot',label='Download Plot')
  ),
  server = function(input, output, session) {
    cols <- reactive({
      lapply(seq_along(unique(input$select)), function(i) {
        colourInput(paste("col", i, sep="_"), "Choose colour:", "black")        
      })
    })

    output$myPanel <- renderUI({cols()})

    cols2 <- reactive({        
      if (is.null(input$col_1)) {
        cols <- rep("#000000", length(input$select))
      } else {
        cols <- unlist(colors())
      }
      cols})

    testplot <- function(){
      dat <- dat[dat$variable %in% input$select, ]
      ggplot(dat, aes(x=variable,y=value, fill=cols2()[1])) + geom_boxplot()}

    output$plot <- renderPlot({testplot()})

    output$downloadplot <- downloadHandler(
      filename ="plot.pdf",
      content = function(file) {
        pdf(file, width=12, height=6.3)
        print(testplot())
        dev.off()
      })
  }
))

我希望用户选择boxplot的填充颜色。将根据selectizeInput("select"...中所选变量的数量显示颜色小部件的数量。直到这一点,一切都运作良好,但进一步我无法弄清楚如何将这种颜色应用于ggplot等...

以下是我的问题:

  1. 我如何正确地将填充颜色连接到ggplot

  2. 我能否使默认颜色colourInput() 与默认调色板相对应(不是一种颜色 - >在我的情况下是>黑色)

  3. 而不是colourInput(paste("col", i, sep="_"), "Choose colour:",中的选择颜色文本我希望拥有变量的相应名称(从selectizeInput中选择变量)(在本例中为X1) ,X2和X3)

  4. 我想要一个可以重置所有所选颜色的按钮

  5. 提前谢谢大家,我希望这可以解决

    干杯

1 个答案:

答案 0 :(得分:6)

这些是非常好的和具体的问题,我很高兴,希望能够回答它们:)

  
      
  1. 如何正确地将填充颜色连接到ggplot
  2.   

在这种情况下,我认为最好的方法是根据variable填充框(这是被动的)并添加一个新的图层scale_fill_manual,您可以在其中为不同的框指定自定义颜色。颜色的数量必须明显等于variable的级别数。这可能是最好的方法,因为你总会有一个正确的传奇。

ggplot(dat, aes(x = variable, y = value, fill = variable)) + 
          geom_boxplot() +
          scale_fill_manual(values = cols)
  
      
  1. 我可以将colourInput()的默认颜色对应默认调色板(不是一种颜色 - 在我的情况下是&gt;是黑色)
  2.   

当然,你可以做到。

首先,您需要知道ggplot使用的离散变量的默认颜色。要生成这些颜色,我们将使用this讨论中的函数gg_color_hue。我已将其名称更改为gg_fill_hue以遵循ggplot惯例。

我们可以在renderUI内编码所有内容,我们首先指定所选的级别/变量。为了消除由于动态(并且可能以不同的顺序)生成的小部件而导致的明确性,我们对级别/变量的名称进行排序。

然后我们使用gg_fil_hue生成适当数量的默认颜色,并将它们分配给相应的小部件。

为方便起见,我们将这些小部件的IDs更改为col +“varname”,由input$select

提供
output$myPanel <- renderUI({ 
      lev <- sort(unique(input$select)) # sorting so that "things" are unambigious
      cols <- gg_fill_hue(length(lev))

      # New IDs "colX1" so that it partly coincide with input$select...
      lapply(seq_along(lev), function(i) {
        colourInput(inputId = paste0("col", lev[i]),
                    label = paste0("Choose colour for ", lev[i]), 
                    value = cols[i]
        )        
      })
    })
  

3.而不是在colourInput中选择颜色文本(粘贴(“col”,i,sep =“_”),“选择颜色:”,我希望拥有相应的名称(从selectizeInput中选择变量)变量(在这种情况下是X1,X2和X3)

它也是在上面的代码中完成的 - 简单粘贴。

现在,让我们来看看由于生成的小部件的动态数量而产生的一个非常重要的问题。我们必须根据唯一的colorInput来设置框的颜色,并且可能有1,2或甚至10个这些输入。

我认为,解决这个问题的一个非常好的方法是创建一个字符向量,其中的元素指定了我们通常如何访问这些小部件。在下面的示例中,此向量如下所示:c("input$X1", "input$X2", ...)

然后使用非标准评估(evalparse),我们可以评估这些输入以获得具有所选颜色的矢量,然后我们将其传递到scale_fill_manual层。

为了防止选择之间可能出现的错误,我们将使用函数`req'来确保带颜色的向量的长度与所选级别/变量的长度相同。

output$plot <- renderPlot({
        cols <- paste0("c(", paste0("input$col", sort(input$select), collapse = ", "), ")")
        # print(cols)
        cols <- eval(parse(text = cols))
        # print(cols)

        # To prevent errors
        req(length(cols) == length(input$select))

        dat <- dat[dat$variable %in% input$select, ]
        ggplot(dat, aes(x = variable, y = value, fill = variable)) + 
          geom_boxplot() +
          scale_fill_manual(values = cols)

    })
  
      
  1. 我想要一个可以重置所有选择颜色的按钮
  2.   

在客户端使用actionButton定义ID="reset"后,我们创建了一个将更新colorInput的观察者。

我们的目标是返回一个包含updateColourInput的列表,并为每个可用的colourInput窗口小部件提供适当的参数化。

我们定义一个包含所有选定级别/变量的变量,并生成适当数量的默认颜色。我们再次对矢量进行排序以避免歧义。

然后我们使用lapplydo.call来调用updateColourInput函数,并使用以列表形式给出的指定参数。

observeEvent(input$reset, {
      # Problem: dynamic number of widgets
      # - lapply, do.call

      lev <- sort(unique(input$select))
      cols <- gg_fill_hue(length(lev))

      lapply(seq_along(lev), function(i) {
              do.call(what = "updateColourInput",
                      args = list(
                        session = session,
                        inputId = paste0("col", lev[i]),
                        value = cols[i]
                      )
              )
      })
    })

完整示例:

library(shiny)
library(shinyjs)
library(reshape2)
library(ggplot2)

dat <- data.frame(matrix(rnorm(60, 2, 3), ncol=3))
dat <- melt(dat)

# Function that produces default gg-colours is taken from this discussion:
# https://stackoverflow.com/questions/8197559/emulate-ggplot2-default-color-palette
gg_fill_hue <- function(n) {
  hues = seq(15, 375, length = n + 1)
  hcl(h = hues, l = 65, c = 100)[1:n]
}

runApp(shinyApp(
  ui = fluidPage(
    selectizeInput("select", "Select:", 
                   choices = as.list(levels(dat$variable)), 
                   selected = "X1", 
                   multiple = TRUE), 
    uiOutput('myPanel'),
    plotOutput("plot"),
    downloadButton('downloadplot', label = 'Download Plot'),
    actionButton("reset", "Default colours", icon = icon("undo"))
  ),
  server = function(input, output, session) {

    output$myPanel <- renderUI({ 
      lev <- sort(unique(input$select)) # sorting so that "things" are unambigious
      cols <- gg_fill_hue(length(lev))

      # New IDs "colX1" so that it partly coincide with input$select...
      lapply(seq_along(lev), function(i) {
        colourInput(inputId = paste0("col", lev[i]),
                    label = paste0("Choose colour for ", lev[i]), 
                    value = cols[i]
        )        
      })
    })


    output$plot <- renderPlot({
      cols <- paste0("c(", paste0("input$col", sort(input$select), collapse = ", "), ")")
      # print(cols)
      cols <- eval(parse(text = cols))
      # print(cols)

      # To prevent errors
      req(length(cols) == length(input$select))

      dat <- dat[dat$variable %in% input$select, ]
      ggplot(dat, aes(x = variable, y = value, fill = variable)) + 
        geom_boxplot() +
        scale_fill_manual(values = cols)

    })


    observeEvent(input$reset, {
      # Problem: dynamic number of widgets
      # - lapply, do.call

      lev <- sort(unique(input$select))
      cols <- gg_fill_hue(length(lev))

      lapply(seq_along(lev), function(i) {
        do.call(what = "updateColourInput",
                args = list(
                  session = session,
                  inputId = paste0("col", lev[i]),
                  value = cols[i]
                )
        )
      })
    })




    output$downloadplot <- downloadHandler(
      filename = "plot.pdf",
      content = function(file) {
        pdf(file, width = 12, height = 6.3)
        print(testplot())
        dev.off()
      })
  }
))