我使用Rcpp包的Rcpp.package.skeleton
函数创建了一个包,其中包含一个.cpp文件,其中C ++函数返回0:
#include <Rcpp.h>
using namespace Rcpp;
// [[Rcpp::export]]
RcppExport SEXP just_zero() {
BEGIN_RCPP
Rcpp::RNGScope __rngScope;
return wrap(0.0);
END_RCPP
}
当我从R安装并加载包时,我可以通过lapply使用.Call调用该函数。正如所料,它(似乎)总是返回0:
> x <- lapply(seq(10000), function(i) { x <- .Call('just_zero'); stopifnot(x == 0); x } )
#*no errors!*
但是,显然lapply
返回的值包含非零值:
> range(simplify2array(x))
[1] 0 3
不幸的是,使用set.seed
并不能使这些返回值重现,有时我会得到[1] 0 0
,有时会得到其他值,例如[1] "0" "TRUE"
。另一条线索是删除行Rcpp::RNGScope __rngScope;
可以解决问题。
为什么lapply
返回的对象中存在非零元素(特别是当我们检查.Call
返回的值时),以及如何使用RNGScope
造成它?
我已经在Linux和OS X上重现了这种行为。来自OS X的会话信息粘贴在下面:
> sessionInfo()
R Under development (unstable) (2016-08-03 r71023)
Platform: x86_64-apple-darwin13.4.0 (64-bit)
Running under: OS X Mavericks 10.9.5
locale:
[1] en_GB.UTF-8/en_GB.UTF-8/en_GB.UTF-8/C/en_GB.UTF-8/en_GB.UTF-8
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
other attached packages:
[1] bug_1.0 devtools_1.12.0
loaded via a namespace (and not attached):
[1] tools_3.4.0 withr_1.0.2 memoise_1.0.0 Rcpp_0.12.6 git2r_0.15.0
[6] digest_0.6.10
答案 0 :(得分:4)
这是一个为我一致地再现问题的例子。
#include <Rcpp.h>
using namespace Rcpp;
// [[Rcpp::export]]
void dummy() {}
extern "C" SEXP just_zero() {
Rcpp::RNGScope rngScope;
return wrap(0.0);
}
/*** R
n <- 1E5
x <- unlist(lapply(seq(n), function(i) {
.Call('just_zero')
}))
unique(x)
*/
在此上调用Rcpp::sourceCpp()
就可以了。例如
> unique(x)
[1] 0 8371 16021 20573 25109 43103 47563 56438 60852 78413 82773 95765
导致此问题的原因是什么?要理解这一点,我们需要了解RNGScope
的定义:我们可以在这里看到它:
及其使用的方法在此处定义:
https://github.com/RcppCore/Rcpp/blob/9fbdf78fe225607dc2c8af7267a6840af0aba10e/src/api.cpp#L63-L75
这里定义了最重要的函数PutRNGState
:
现在,这实际上是在调用just_zero
时发生的情况:
RNGScope
对象已创建,其关联的析构函数已准备好运行。wrap(0.0)
的结果,即REALSXP
长度为1且值为0的结果。请注意,此对象不受保护,因此符合垃圾回收条件。RNGScope
析构函数。PutRNGstate()
,它本身将调用allocVector
,从而触发垃圾收集器。这意味着可以收集您想要返回的SEXP
对象,因此将是垃圾!所以,总而言之 - 使用Rcpp属性,因为它会安全地为你完成这一切。
要了解为什么Rcpp属性使这个安全&#39;,请查看生成的代码:
// just_zero
SEXP just_zero();
RcppExport SEXP sourceCpp_0_just_zero() {
BEGIN_RCPP
Rcpp::RObject __result;
Rcpp::RNGScope __rngScope;
__result = Rcpp::wrap(just_zero());
return __result;
END_RCPP
}
请注意,输出结果已分配给保护对象的Rcpp::RObject
,我们确保在 RNGScope
对象之前构造此对象,这样可以确保在RNGScope
析构函数运行时保持受保护。
答案 1 :(得分:3)
这不是一个完全答案,但我会随着它的扩展而扩展它。但是,我无法在macOS上重现此行为。
我相信您遇到的问题是由于您使用RcppExport和Rcpp属性,例如:
// [[Rcpp::export]]
RcppExport SEXP just_zero()
应该通过以下方式完成:
library("Rcpp")
cppFunction("double just_zero() {
return 0.0;
}")
x <- lapply(seq(10000), function(i) { x <- just_zero(); stopifnot(x == 0); x } )
all(range(simplify2array(x)) == 0)
或将以下内容放入file.cpp
:
#include <Rcpp.h>
using namespace Rcpp;
// [[Rcpp::export]]
double just_zero() {
return 0.0;
}
/*** R
x <- lapply(seq(10000), function(i) { x <- just_zero(); stopifnot(x == 0); x } )
all(range(simplify2array(x)) == 0)
*/
如果打算使用sourceCpp()
。