Xcode 7.3文件的源控制问题

Question

我已手动在本地服务器上推送代码。之后使用CornerStone检查项目。

但是，该项目包含的文件具有不同的版本状态，即A，M和A +。

但 CornerStone中的项目显示任何这些版本状态。

我尝试通过提交文件来修复它（显示提交成功），但它保持不变。

我担心，因为会在以后阶段产生混淆。

如何解决这个问题？