是否有使用SCons和ASP.NET Core
生成knitr
个文件报告的极少甚至更大的工作示例?
.Rmd
命令行(knit
shell)中的cleaning_session.Rmd
文件来派生bash
文件,可以通过以下方式完成:
.html
在此example中,Rscript和说明被提供给Rscript -e "library(knitr); knit('cleaning_session.Rmd')".
文件:
Make
在这个答案https://stackoverflow.com/a/10945832/1172302中,据报道有一个使用SCons的解决方案。然而,我没有足够的测试让它适合我。从本质上讲,像https://tex.stackexchange.com/a/26573/8272中提供的示例一样,会很棒。
答案 0 :(得分:1)
[已更新]一个有效的示例是Sconstruct
文件:
import os
environment = Environment(ENV=os.environ)
# define a `knitr` builder
builder = Builder(action = '/usr/local/bin/knit $SOURCE -o $TARGET',
src_suffix='Rmd')
# add builders as "Knit", "RMD"
environment.Append( BUILDERS = {'Knit' : builder} )
# define an `rmarkdown::render()` builder
builder = Builder(action = '/usr/bin/Rscript -e "rmarkdown::render(input=\'$SOURCE\', output_file=\'$TARGET\')"',
src_suffix='Rmd')
environment.Append( BUILDERS = {'RMD' : builder} )
# define source (and target files -- currently useless, since not defined above!)
# main cleaning session code
environment.RMD(source='cleaning_session.Rmd', target='cleaning_session.html')
# documentation of the Cleaning Process
environment.Knit(source='Cleaning_Process.Rmd', target='Cleaning_Process.html')
# documentation of data
environment.Knit(source='Code_Book.Rmd', target='Code_Book.html')
第一个构建器调用名为knit
的自定义脚本。反过来,它负责目标文件/扩展,这里是cleaning_session.html
。在这个例子中,可能完全不需要suffix
参数。
添加的第二个构建器为Rscript -e "rmarkdown::render(\'$SOURCE\')"'
。
如果目标文件已存在,$TARGET
的存在(如Command wrapper中的示例所示)可确保SCons
不会重复工作。
自定义脚本(我目前无法检索的源代码)是:
#!/usr/bin/env Rscript
local({
p = commandArgs(TRUE)
if (length(p) == 0L || any(c('-h', '--help') %in% p)) {
message('usage: knit input [input2 input3] [-n] [-o output output2 output3]
-h, --help to print help messages
-n, --no-convert do not convert tex to pdf, markdown to html, etc
-o output filename(s) for knit()')
q('no')
}
library(knitr)
o = match('-o', p)
if (is.na(o)) output = NA else {
output = tail(p, length(p) - o)
p = head(p, o - 1L)
}
nc = c('-n', '--no-convert')
knit_fun = if (any(nc %in% p)) {
p = setdiff(p, nc)
knit
} else {
if (length(p) == 0L) stop('no input file provided')
if (grepl('\\.(R|S)(nw|tex)$', p[1])) {
function(x, ...) knit2pdf(x, ..., clean = TRUE)
} else {
if (grepl('\\.R(md|markdown)$', p[1])) knit2html else knit
}
}
mapply(knit_fun, p, output = output, MoreArgs = list(envir = globalenv()))
})
现在唯一需要的是运行scons
。