我使用tkinter和pyinstaller / py2exe（任何一个都没问题），从我的python脚本创建一个可执行文件作为单个文件。我可以创建可执行文件，当不使用py2exe的bundle选项或pyinstaller的-F选项时，它可以根据需要运行。我使用os.system（）在我的代码中运行第三方python脚本，并且可以简单地将这些脚本放在＆＃39; dist＆＃39; dir创建后才能使其工作。该命令有几个参数：输入文件，输出文件，线程数等等，所以我不确定如何使用import将其添加到我的代码中。不幸的是，这是在Windows上，因此一些同事可以使用GUI，并希望分发单个可执行文件。
**编辑：**我可以将它捆绑到一个可执行文件中，并提供脚本和exe。但是，在我的代码中运行第三方脚本时，问题仍然是os.system("python script.py -1 inputfile -n numbthreads -o outputfile..")。我有一位同事用它提供的脚本测试可执行文件，但是此时他们需要安装python，这是不可接受的，因为会有多个用户。
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经过几天的测试后，我能够弄清楚如何解决这个问题。而不是os.system，我使用subprocess.call("script.py arg1 arg2 ..., shell=True)来运行我需要的每个脚本。此外，我在将脚本传输到Windows之前使用chmod +x（在linux中）以确保它们是可执行文件（有人可以告诉我这是否真的有必要）。然后，在我使用pyInstaller将其编译为单个文件之后，无需安装python，同事就能够运行该程序。我还能用blast可执行文件做同样的事情（用户不需要在本地安装blast - 如果exe也伴随着脚本的分发）。这避免了调用bipython ncbiblastncommandline和安装。