有没有办法根据另一个数据框的列从数据框中删除行?
例如,Dataframe 1:
Gene CHROM POS REF ALT N_INFORMATIVE Test Beta SE
AAA 1 15211 T G 1481 1:15211 -0.0599805 0.112445
LLL 1 762061 T A 1481 1:762061 0.2144100 0.427085
CCC 1 762109 C T 1481 1:762109 0.2847510 0.204255
DDD 1 762273 G A 1481 1:762273 0.0443946 0.119924
Dataframe 2(仅1列):
Genes
AAA
BBB
CCC
DDD
EEE
FFF
在这种情况下,我想扫描Dataframe 1,第1列以查找与Dataframe 2的任何匹配,并删除匹配的行。
他们需要完全匹配,结果如下:
Gene CHROM POS REF ALT N_INFORMATIVE Test Beta SE
LLL 1 762061 T A 1481 1:762061 0.2144100 0.427085
我尝试过这种变体,但它没有奏效:
NewDataframe <-!(Dataframe1$Gene==Dataframe2$Genes)
感谢阅读。
答案 0 :(得分:4)
使用%in%
识别第一个数据帧中哪些元素未包含在第二个数据帧中,然后将生成的逻辑向量传递给第一个数据帧到子集。
dat1 <- data.frame(id = LETTERS[1:10], stringsAsFactors = FALSE)
dat2 <- data.frame(id = c("B", "D"), stringsAsFactors = FALSE)
dat1[!dat1$id %in% dat2$id, , drop = FALSE]
# id
# 1 A
# 3 C
# 5 E
# 6 F
# 7 G
# 8 H
# 9 I
# 10 J