Python凝聚聚类:找到聚类中最近的点

时间:2016-07-23 15:04:33

标签: python hierarchical-clustering

用于聚类的链接矩阵提供聚类索引和距离 对于群集层次结构的每个步骤。 当两个集群合并时,我想知道集群中哪两个点最接近。我正在使用指标"单一"即最近距离

我知道我可以通过详尽的搜索和比较来做到这一点。链接后信息是否已存在?有更聪明的方法来获取这些信息吗?

1 个答案:

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  • 不,此信息在链接后不可用,至少根据官方Python文档。

  • 最接近的点问题是计算几何的问题,可以通过递归除法和征服算法在对数时间内求解(注意穷举搜索是二次的)。有关详细信息,请参阅此Wikipedia article。另请查看Shamos和Hoey的paper。请注意,问题的原始表述仅涉及一组点。但是,适应两套很简单;您可能会发现此discussion有用。