为什么' X'和' Y'绘制距离时长度是否不同?

时间:2016-07-18 20:04:24

标签: r dataframe distance melt

我试图将我的生物数据值映射到它们在R中的单一距离。但是,我得到的错误是数据类别不同,这就是为什么我随后在我的情节中出错,所以我将两者转换为矩阵,但是当我运行时仍然会出错:

unifrac.melt <- melt(as.matrix(unifrac.w))
unifrac.melt <- t(unifrac.melt)
fi.melt <- melt(as.matrix(data$fi)) #convert to dataframe
fi.melt <- t(fi.melt)
class(fiber.melt)

plot(fi.melt ~ unifrac.melt)

Error in xy.coords(x, y, xlabel, ylabel, log): 'x' and 'y' lengths differ

如果有人有任何建议请告诉我!

fi.melt如何出现:

row.names   V1          V2          V3  
1   Var1    1.00000     2.000000    3.000000
2   Var2    1.00000     1.000000    1.000000    
3   value   10.43247    8.837031    7.093047

unifrac.melt如何出现:

row.names   V1          V2          V3  
1   Var1    30841102    49812105    26402102    
2   Var2    X30841102   X30841102   X30841102   
3   value   0.00000000  0.50184564  ....

数据显示为这样,其中有13个变量的152个观察值:

 row.names  BSequence   Sequence    Fi  FiCategory  Wg  WgCategory  V   VCategory   Fr  FrCategory  TVs An  Description
 1  30841102    CGATGCTGTAGATCGC    CTGTCTCTTATACACATCT 10.432465   Low 3.289473    Low 164.952225  Low 0.000000    None    222.952225  Yes NA
 2  49812105    TAATGAGCTAACCTCT    CTGTCTCTTATACACATCT 8.837031    Low 0.254120    Low 85.095326   Low 0.275000    Low 90.720326   No  NA
 3  26402102    TCCTGTTCTATCCTCT    CTGTCTCTTATACACATCT 7.093047    Low 2.619711    Low 96.203285   Low 0.000000    None    114.703285  No  NA

因此,为了重现性,

原始数据如下:

  envd <- matrix(rexp(2000, rate=.1), nrow=3, ncol=1976)

&#34;连接&#34;是envd的第3列

unifrac.melt就像:

  unifracd <- matrix(rexp(30000, rate=.1), nrow= 3, ncol= 23104)

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