Question

在我合作的python项目中，我们最初打算将输入fasta文件中的信息解析为字典。

解析方法已经实现（here和here），问题是：在Python3中运行时代码工作正常（加载fasta文件，解析FDB数据结构的信息，然后它保存在一个新的fdb文件中），但是当它在Python 2中运行时，生成的字典不包含读取fasta文件中的值信息，只包含键。

以上链接显示为解析而开发的代码，下面的块包含我们执行的测试（适用于Python 3，但不能在Python 2中保存fasta信息）。

print("Instantiating a FastaDB object...")
fasta_db = FastaDB()
print("Defining input file name...")
filename = "../FastaDB/test2.fasta"
username = "inacio_medeiros"
print("Invoking FDB parsing...")
parsed_fdb_structure = fasta_db.ImportFasta(filename, username)
print("Saving in file...")
content = json.dumps(parsed_fdb_structure)
fdb_file_name = filename+".fdb"
fdb_file = open(fdb_file_name, "w")
fdb_file.write(content)

有没有人知道为什么词典在Python 3中正常工作，而在Python 2中却没有？

Answer 1

问题不在于字典，而在于如何创建类。在python3上，所有类都继承自object类（除非你实际上让它继承自其他类），在python2上它们不会。

因此，python3上的class A()与class A(object)相同，但在python2上它们是不同的东西：后者是“新风格类”，而前者是“旧风格类” 。我也是一个python3人，所以这对我来说是新的，但是你可以找到关于这个https://github.com/kelemen/netbeans-gradle-project/wiki/Built-In-Tasks的更多信息

TL; DR：只需将class FDBRegister():替换为class FDBRegister(object):即可！我在这里测试过;）

通过Python3在字典中保存信息工作正常，但在Python2中没有

1 个答案: