Question

当我尝试运行以下命令时： R --slave --no-save --no-restore -e "print('foo')"

我得到： /usr/local/bin/R: line 193: /usr/local/Library/ENV/4.3/sed: No such file or directory ERROR: option '-e' requires a non-empty argument

显然brew最近将ENV文件夹移到了新路径（请参阅here）。我知道我可以轻松地对新的sed目录进行符号链接以修复问题，但我想知道是否有更好的解决方法/修复（最终如果这将在R源代码中修复）。

Answer 1

这是因为brew已更改了this commit中的路径，因此如果您在过去4天内运行brew update，则会导致破损。

此blindjesse的信用额转至answer，即brew reinstall -s r。

当我尝试这个时，我遇到了一些其他问题。我没有安装X11并且我与tcl-tk发生了冲突，这意味着它在编译时会导致其他一些失败：

我从https://www.xquartz.org
将其符号链接到我的自制文件夹ln -s /opt/X11/include/X11 /usr/local/include/X11（请注意您的自制程序目录可能不同）
brew install homebrew/dupes/tcl-tk brew link --overwrite --force tcl-tk; brew unlink tcl-tk
brew reinstall -s r

然后它对我有用。我认为一旦r瓶升级，这个问题应该会消失，但目前这就是我必须做的事情。

Answer 2

升级到Sierra，尝试了上面的命令以及这里的指示：https://github.com/Homebrew/homebrew-science/issues/4338。之后我按照这里的说明重新安装了R内核：https://github.com/IRkernel/IRkernel，事情又开始了。 OY合租。

要重新安装R内核，请在终端中启动R并输入以下内容：

install.packages(c('repr', 'IRdisplay', 'crayon', 'pbdZMQ', 'devtools'))
devtools::install_github('IRkernel/IRkernel')
IRkernel::installspec()  # to register the kernel in the current R installation

Answer 3

与其对sed的路径进行硬编码，一种简单的解决方法是编辑R脚本并使用

更改第193行

SED=$(which sed)

使用-e标志运行R时找不到Sed目录

3 个答案: