我有一个名为“annotation”的目录，其中有多个以样本ID命名的子目录，如“A21”，“B32”，“D54”等。例如，在一个名为“A21”的子目录中，将有一个名为“A21.snp.annotation.xls”的excel文件，其中我想提取前四列，即第21和第72列。
提取六列后，文件将以如下相似的方式显示：
chr pos ref alt gene snp
1 123 A T gene1 rs111
2 234 C G gene2 rs222
最后一列“snp”可以用作不同样本的索引，所以我想使用“snp”作为索引合并不同的样本，最终文件将以下列方式显示：
snp A21 B32 D54
rs111 AT AT TT
rs222 CG CC GG
然后我想计算ref等位数，最终文件将显示为
snp A21 B32 D54
rs111 1 1 0
rs222 1 2 0