如何在Cython中对内存视图进行排序?是否有内置功能可以做到这一点?现在我必须使用numpy
数组,并使用numpy
排序,这非常慢。
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要跟进我的评论,这里有3个选项(numpy和C和C ++标准库选项)
from libcpp.algorithm cimport sort
from libc.stdlib cimport qsort
import numpy as np
def sort_numpy(double[:] a, kind):
np.asarray(a).sort(kind=kind)
# needs to be compiled with C++
def sort_cpp(double[::1] a):
# a must be c continuous (enforced with [::1])
sort(&a[0], (&a[0]) + a.shape[0])
# The C version requires a comparator function
# which is a little slower since it requires calling function pointers
# and passing pointers rather than numbers
cdef int cmp_func(const void* a, const void* b) nogil:
cdef double a_v = (<double*>a)[0]
cdef double b_v = (<double*>b)[0]
if a_v < b_v:
return -1
elif a_v == b_v:
return 0
else:
return 1
def sort_c(double[:] a):
# a needn't be C continuous because strides helps
qsort(&a[0], a.shape[0], a.strides[0], &cmp_func)
您将依赖于您正在使用的C / C ++标准库的结果,因此不会过多地阅读我的结果。对于1000长阵列(排序5000次),我得到:
np quick: 0.11296762199890509 np merge: 0.20624926299933577 np heap: 0.2944786230000318 c++: 0.12071316699984891 c: 0.33728832399901876
即。 numpy版本最快。对于100长阵列,我得到了
np quick: 0.022608489000049303 np merge: 0.023513408999860985 np heap: 0.024136934998750803 c++: 0.008449130998997134 c: 0.01909676999821386
即如果你要对很多小数组进行排序,那么调用numpy排序的开销很大,你应该使用C ++(或者可能是C)。如果你正在对大型数组进行排序,你可能会发现很难打败numpy。