错误：在R（v 2.7.0）中找不到'AnnotationDbi'所需的包“DBI”

Question

我安装旧版本的R（Windows版本2.7.0）。

要在R中使用bioconductor，请使用source("http://bioconductor.org/getBioC.R")

biocLite("GO.db")
library("GO.db")

当我加载GO.db时，它会出错：

  

加载必需的包：AnnotationDbi

     

错误：无法找到'AnnotationDbi'所需的包'DBI'

我该如何解决这个问题？请帮助。

Answer 1

R包通常需要或依赖于其他包。例如，GO.db需要AnnotationDbi。当Bioconductor中的封装需要另一个Bioconductor封装时，它通常会同时安装两个封装。

不幸的是，有时Bioconductor的包需要CRAN的包，您需要单独安装每个包。在这种情况下，DBI需要AnnotationDbi，但它在CRAN上。

尝试安装DBI：

install.packages("DBI")

然后尝试加载GO.db。您可能需要再次重新安装AnnotationDbi才能使其正常运行。