Question

如果需要，每4小时文件会更新一次新信息 - 即，是否为该特定文件处理了任何新信息（文件对应于人）。

我正在运行此命令将我的.stp文件（每4小时更新一次）转换为.xml文件。

rule convert_waveform_stp:
    input:  '/data01/stpfiles/{file}.Stp'
    output: '/data01/workspace/bm_data/xmlfiles/{file}.xml'
    shell:
        '''
        mono /data01/workspace/bm_software/convert.exe {input} -o {output}
        '''

我的脚本位于Snakemake（基于python），但我通过shell命令运行convert.exe。

我在使用convert.exe处理过的内容时遇到错误。它们被convert.exe保存为写保护，并且没有选项可以绕过可执行文件本身。

错误讯息：

ProtectedOutputException in line 14 of /home/Snakefile:
Write-protected output files for rule convert_waveform_stp:
/data01/workspace/bm_data/xmlfiles/PID_1234567.xml

我仍然希望它们受到写保护，但也希望能够根据需要更新它们。

我可以添加到shell命令中来写一些写保护文件吗？

Answer 1

看一下os标准库包：

https://docs.python.org/3.5/library/os.html?highlight=chmod#os.chmod

它允许chmod具有以下警告：

虽然Windows支持chmod（），但您只能使用它设置文件的只读标志（通过stat.S_IWRITE和stat.S_IREAD常量或相应的整数值。所有其他位都被忽略。

@ VickiT05，我以为你想在python中使用它。试试这个：

使用

检查原始文件权限

ls -l [your file name]

stat -c %a [your file name]

将保护更改为

chmod 777 [your file name]

更改回原始文件模式或您想要的任何模式

chmod [original file protection mode] [your file name]

重写写保护文件

1 个答案: