Question

亲爱的论坛我想用一个注释列表索引患者数据列表，其中每个元素都是一个nx1数组。

患者清单：例如10名患者，20个特征，300个数据点（列表的每个元素是300x20阵列）注释列表：例如10名患者，300名注释

目的是创建一个包含患者值的列表，其值通过以下方式选择：

我想要的病人
我想要的功能
我想要的带注释数据

在这个伟大的论坛的帮助下，我设法选择患者和功能（F1，F2，F3）：

 F1=5;F2=13;F3=74     
 selected_babies =[0,1,2]
 Xfeat=[val[:,(F1,F2,F3)] for sb, val in enumerate(Patient_Matrix) if sb in selected_babies] #selecting top three fearues F1 F2 F3 datapoints

然后我创建一个列表，其中的索引与我想要的注释相对应。在这种情况下为1和2.

label=array([1,2])
idx=[in1d(Annottions[sb],label) for sb in selected_babies]
idx=[nonzero(idx[sb])[0] for sb in selected_babies] # get the indices where True

如上所述，idx现在是一个包含3个元素的List（由于selected_babies），其中每个元素都是n个值的数组，表示我想要使用的数据的索引。现在我想使用此列表从创建的Xfeat中选择我的数据。到目前为止，它包含功能F1，F2和F3的所有值。我只想要所选婴儿的F1，F2，F3的1和2注释值。

我试过了：

Xfeat=[val[idx[sb],:] for sb, val in enumerate(Patient_Matrix) if sb in selected_babies]    #selecting the datapoints in label

但它不起作用。 IndexError：索引0超出轴0的大小为0的范围。

有谁知道如何做到这一点？

非常感谢您的帮助。

Answer 1

我似乎对此有用：

Xfeat=[val[idx[sb],:] for sb, val in enumerate(Xfeat) if sb in selected_babies]

我仍然得到indexError，但仅针对某位患者。我将不得不弄清楚那里发生了什么。希望我能帮助别人。

干杯

使用包含数组

1 个答案: