我需要将lm()
应用于我的数据框dat
的放大子集,同时预测下一次观察。例如,我正在做:
fit model predict
---------- -------
dat[1:3, ] dat[4, ]
dat[1:4, ] dat[5, ]
. .
. .
dat[-1, ] dat[nrow(dat), ]
我知道我应该为特定的子集做什么(与此问题相关:predict() and newdata - How does this work?)。例如,为了预测最后一行,我做
dat1 = dat[1:(nrow(dat)-1), ]
dat2 = dat[nrow(dat), ]
fit = lm(log(clicks) ~ log(v1) + log(v12), data=dat1)
predict.fit = predict(fit, newdata=dat2, se.fit=TRUE)
如何自动为所有子集执行此操作,并可能将我想要的内容提取到表中?
fit
开始,我需要summary(fit)$adj.r.squared
; predict.fit
我需要predict.fit$fit
值。感谢。
答案 0 :(得分:4)
(高效)解决方案
这是你可以做的:
p <- 3 ## number of parameters in lm()
n <- nrow(dat) - 1
## a function to return what you desire for subset dat[1:x, ]
bundle <- function(x) {
fit <- lm(log(clicks) ~ log(v1) + log(v12), data = dat, subset = 1:x, model = FALSE)
pred <- predict(fit, newdata = dat[x+1, ], se.fit = TRUE)
c(summary(fit)$adj.r.squared, pred$fit, pred$se.fit)
}
## rolling regression / prediction
result <- t(sapply(p:n, bundle))
colnames(result) <- c("adj.r2", "prediction", "se")
注意我在bundle
函数中做了几件事:
subset
参数来选择适合的子集model = FALSE
来保存模型框架,因此我们保存了工作区总的来说,没有明显的循环,但使用了sapply
。
p
开始拟合,即使用p
系数拟合模型所需的最小数据量; nrow(dat) - 1
,因为我们至少需要最后一列进行预测。<强>测试强>
示例数据(带有30个“观察结果”)
dat <- data.frame(clicks = runif(30, 1, 100), v1 = runif(30, 1, 100),
v12 = runif(30, 1, 100))
上面的代码给出results
(总共27行,5行的截断输出)
adj.r2 prediction se
[1,] NaN 3.881068 NaN
[2,] 0.106592619 3.676821 0.7517040
[3,] 0.545993989 3.892931 0.2758347
[4,] 0.622612495 3.766101 0.1508270
[5,] 0.180462206 3.996344 0.2059014
第一列是拟合模型的调整后的R.squared值,而第二列是预测值。 adj.r2
的第一个值是NaN
,因为我们拟合的第一个模型有3个数据点的3个系数,因此没有可用的统计数据。 se
也是如此,因为拟合线没有0残差,所以预测没有不确定性。
答案 1 :(得分:1)
我刚刚编写了一些随机数据用于此示例。我正在调用对象data
,因为在我编写此解决方案时(在您喜欢的任何地方调用它),这就是问题中所调用的内容。
(高效)解决方案
data <- data.frame(v1=rnorm(100),v2=rnorm(100),clicks=rnorm(100))
data1 = data[1:(nrow(data)-1), ]
data2 = data[nrow(data), ]
for(i in 3:nrow(data)){
nam <- paste("predict", i, sep = "")
nam1 <- paste("fit", i, sep = "")
nam2 <- paste("summary_fit", i, sep = "")
fit = lm(clicks ~ v1 + v2, data=data[1:i,])
tmp <- predict(fit, newdata=data2, se.fit=TRUE)
tmp1 <- fit
tmp2 <- summary(fit)
assign(nam, tmp)
assign(nam1, tmp1)
assign(nam2, tmp2)
}
您想要的所有结果都将存储在此创建的数据对象中。
例如:
> summary_fit10$r.squared
[1] 0.3087432
您在评论中提到您想要结果表。您可以通过编程方式从3种类型的输出文件中创建结果表,如下所示:
rm(data,data1,data2,i,nam,nam1,nam2,fit,tmp,tmp1,tmp2)
frames <- ls()
frames.fit <- frames[1:98] #change index or use pattern matching as needed
frames.predict <- frames[99:196]
frames.sum <- frames[197:294]
fit.table <- data.frame(intercept=NA,v1=NA,v2=NA,sourcedf=NA)
for(i in 1:length(frames.fit)){
tmp <- get(frames.fit[i])
fit.table <- rbind(fit.table,c(tmp$coefficients[[1]],tmp$coefficients[[2]],tmp$coefficients[[3]],frames.fit[i]))
}
fit.table
> fit.table
intercept v1 v2 sourcedf
2 -0.0647017971121678 1.34929652763687 -0.300502017324518 fit10
3 -0.0401617893034109 -0.034750571912636 -0.0843076273486442 fit100
4 0.0132968863522573 1.31283604433593 -0.388846211083564 fit11
5 0.0315113918953643 1.31099122173898 -0.371130010135382 fit12
6 0.149582794027583 0.958692838785998 -0.299479715938493 fit13
7 0.00759688947362175 0.703525856001948 -0.297223988673322 fit14
8 0.219756240025917 0.631961979610744 -0.347851129205841 fit15
9 0.13389223748979 0.560583832333355 -0.276076134872669 fit16
10 0.147258022154645 0.581865844000838 -0.278212722024832 fit17
11 0.0592160359650468 0.469842498721747 -0.163187274356457 fit18
12 0.120640756525163 0.430051839741539 -0.201725012088506 fit19
13 0.101443924785995 0.34966728554219 -0.231560038360121 fit20
14 0.0416637001406594 0.472156988919337 -0.247684504074867 fit21
15 -0.0158319749710781 0.451944113682333 -0.171367482879835 fit22
16 -0.0337969739950376 0.423851304105399 -0.157905431162024 fit23
17 -0.109460218252207 0.32206642419212 -0.055331391802687 fit24
18 -0.100560410735971 0.335862465403716 -0.0609509815266072 fit25
19 -0.138175283219818 0.390418411384468 -0.0873106257144312 fit26
20 -0.106984355317733 0.391270279253722 -0.0560299858019556 fit27
21 -0.0740684978271464 0.385267011513678 -0.0548056844433894 fit28