Question

这是我到目前为止所用的，它不是出于某种原因用G替换C.为什么会这样？

DNASeq=raw_input("Enter the DNA sequence here: ")
DNASeq=DNASeq.upper().replace(" ","")

reverse=DNASeq[::-1]

print reverse.replace('A','U').replace('T','A').replace('C','G').replace('G','C')

Answer 1

问题是您将C替换为G，然后将G替换为C。阻止您从一个转到另一个的一种简单方法是将C替换为g，因此它不会返回C，然后将结果大写：

gattaca="GATTACA"
rev = gattaca[::-1]
print rev.replace('A','u').replace('T','a').replace('C','g').replace('G','c').upper()

这正确地输出了UGUAAUC而不是UCUAAUC，就像你的例子一样。

更新

更多的Pythonic方式，并避免基于案例的黑客，并且因为字符串不需要被扫描五次而且更加有效，并且更明显的目的，将是：< / p>

from string import maketrans
transtab = maketrans("ATCG", "UAGC")
print rev.translate(transtab)

Answer 2

正如已经指出的那样，问题是你首先用Gs替换所有Cs。我想抛弃这种方法，因为我认为它会是最有效的：

>>> complement = {'A':'U', 'G':'C', 'C':'G','T':'A'}
>>> seq = "GATTACA"
>>> "".join(complement[c] for c in seq)[::-1]
'UGUAAUC'
>>>

Answer 3

你做了几乎正确的代码。但是你需要理解的一件事是首先用G代替C，然后用C代替G.

.replace（＆＃39; C＆＃39;＆＃39; G＆＃39）。代替（＆＃39; G＆＃39;，＆＃39; C＆＃39）

从代码中删除.replace('G','C')，一切正常。

这是正确的代码：

DNASeq=raw_input("Enter the DNA sequence here: ")
DNASeq=DNASeq.upper().replace(" ","")

reverse=DNASeq[::-1]

print reverse.replace('A','U').replace('T','A').replace('C','G').replace('G','C')

如何在python中替换和反转字符串？

3 个答案:

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