Question

pathToBins=$1

bins="${pathToBins}contigs.fa.metabat-bins-*"

for fileName in $bins
do
    echo $fileName

done

我的目标是将路径附加到我的文件名。当我没有附加路径时，我可以遍历文件夹并获取文件名。我的挑战是，当我添加路径echo fileName时，我的正则表达式不再有效，我得到了＆＃34; /home/erikrasmussen/Desktop/Script/realLargeMetaBatBinscontigs.fa.metabat-bins - *＆＃34;正则表达式＆＃39; *＆＃39;被视为一个字符串。如何在迭代文件夹时获取路径和完整文件名？

Answer 1

虽然我真的不知道你的文件是如何安排在你的硬盘上的，但偶然看一眼"/home/erikrasmussen/Desktop/Script/realLargeMetaBatBinscontigs.fa.metabat-bins-*"表明它在{{1}之前缺少 / }。如果是这种情况，那么您应该将bin的定义更改为：

contigs

但是，使用bash数组而不是依赖文件名来包含空格和元字符要强得多。所以我建议：

bins="${pathToBins}/contigs.fa.metabat-bins-*"

Bash通常不会展开与任何文件都不匹配的模式，因此在这种情况下您将看到原始模式。如果你使用上面的数组公式，你可以设置bash选项bins=(${pathToBins}/contigs.fa.metabat-bins-*) for fileName in "${bins[@]}" do echo "$fileName" done，这将导致不匹配的模式消失，留下一个空数组。

在Bash中使用指定路径迭代目录

1 个答案: