Question

我正在尝试使用Rcpp代码构建一个使用外部库的R包。我以前曾问过如何在包here中使用外部C库。我遇到的问题是，只要我包含以下代码行

y = N_VNew_Serial(3);

我收到错误

sundials_test.o:sundials_test.cpp:(.text+0x2ba): undefined reference to `N_VNew_Serial'
collect2: ld returned 1 exit status
Error in Rcpp::sourceCpp("src/sundials_test.cpp") : 
  Error occurred building shared library

我没有收到行

的错误

N_Vector y = NULL;

所以，我认为与图书馆的连接工作正常。我还确认N_VNewSerial()的函数声明在nvector/nvector_serial.h中。如果您需要查看整个包代码，可以使用here

特定Rcpp文件的代码粘贴在

下面

#include <Rcpp.h>

// #include <iostream.h>
#include <cvode/cvode.h>               /* prototypes for CVODE fcts., consts. */
#include <nvector/nvector_serial.h>    /* serial N_Vector types, fcts., macros */
#include <cvode/cvode_dense.h>         /* prototype for CVDense */
#include <sundials/sundials_dense.h>   /* definitions DlsMat DENSE_ELEM */
#include <sundials/sundials_types.h>   /* definition of type realtype */

using namespace Rcpp;

void InitialConditions (NumericVector x){

  N_Vector y = NULL;
  // y = N_VNew_Serial(3);
  //
  // NV_Ith_S(y,0) = 1;
  // NV_Ith_S(y,1) = 2;
  // NV_Ith_S(y,2) = 3;


}

我不确定为什么代码会在同一个头文件中向一个函数报告undefined reference而不报告另一个函数，并且理解解决此错误的任何帮助都将受到高度赞赏。

谢谢！

SN248

Answer 1

这是链接错误，而不是编译错误。编译成功，让您进入链接步骤。但是

sundials_test.o:sundials_test.cpp:(.text+0x2ba): \
  undefined reference to `N_VNew_Serial'
collect2: ld returned 1 exit status
Error in Rcpp::sourceCpp("src/sundials_test.cpp") : 
  Error occurred building shared library

非常明确：R无法构建共享库，因为您没有链接来对象提供它的目标代码（来自Sundials，我猜是）。

使用外部C库

1 个答案: