随机效果,glmer,嵌套设计

时间:2016-06-13 15:21:46

标签: statistics

我有以下问题: 我正在分析不同基因型(A,B和C)之间种子囊的数量 每个基因型我有4个重复,在每个重复中,我有8个植物。以下是数据示例: 基因型Replicate_ID Plant_ID Seed_capsules A 1 1 6 A 1 2 10 A 1 3 15 B 2 1 100 B 2 2 40 B 2 3 63 C 3 1 80 C 3 2 90 C 3 3 100

我在数据上使用了glmer,但我不确定我的随机是replicate_ID还是plant_ID或两者。这是我到目前为止尝试过的一个例子: freplicate_ID< - factor(newdata $ replicate_ID) fplant_ID< - factor(newdata $ plant_ID) m5< - glmer(seed_capsules~pop_ID +(1 | freplicate_ID / fplant_ID),family = poisson,data = data)

此外,我如何获得这种模型的诊断图?如何比较基因型?我需要在模型上运行lsmeans吗?像这样例如: lsmeans(m5,pairwise~pop_ID,data = newdata)。 我提前感谢你的帮助。 最好, 安娜

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