我在植物根部的不同部位有一些基因表达数据（见图），我想在根部的不同部位显示基因表达水平。例如，如果基因在顶端分生组织中高度表达，我想将原理图中的顶端分生组织部分标记为红色。一种可能性是使图表成为地图，是否有人有任何建议如何将图表制作成R中的地图？或者，如果您知道任何用于此目的的工具，请告诉我。谢谢！
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您可以使用the raster package绘制自己的多边形以区分区域。或者，this post可能会提供更好的方法。
然后，您可以在多边形内创建热图和颜色。用ggplot2::geom_polygon()
为了让它看起来更好，您可以将原始图像用作背景，然后使用一些透明度（即alpha中的ggplot2参数）覆盖您的热图，这样您就可以看到彩色热图和一些原始图像。有关详细信息，请参阅this post;如果您喜欢有趣的图片，请参阅this post
