Question

我使用的是Red Hat 5，无法安装rJava Package

我运行了以下命令：

$ R CMD javareconf -e

我收到以下错误： -

尝试编译并链接JNI程序检测到的JNI cpp标志：

检测到JNI链接器标志：

gcc -m64 -std = gnu99 -I / usr / include / R -DNDEBUG -I / usr / local / include
  -fpic -O2 -g -pipe -Wall -Wp，-D_FORTIFY_SOURCE = 2 -fexceptions -fstack-protector --param = ssp-buffer-size = 4 -m64 -mtune = generic -fpic -fPIC -c conftest.c - o conftest.o

conftest.c：1：17：致命错误：jni.h：没有这样的文件或目录

编译终止。

make：*** [conftest.o]错误1

无法编译JNI程序

java -version如下： -

java版“1.8.0_91”

Java（TM）SE运行时环境（版本1.8.0_91-b14）

Java HotSpot（TM）64位服务器VM（版本25.91-b14，混合mod

JAVA_HOME = /usr/java/jdk1.8.0_91/jre

任何人都可以帮我编译JNI程序

Answer 1

我在Ubuntu上遇到过类似的问题。确定您缺少的文件在哪里

find / -name jni.h 2> /dev/null

可能会像

一样

/usr/lib/jvm/java-8-openjdk-amd64/include

您可能也缺少jni_md.h，然后执行类似下面的操作，其中路径已针对上面确定的路径进行更正。

R CMD javareconf JAVA_CPPFLAGS="-I/usr/lib/jvm/java-8-openjdk-amd64/include -I/usr/lib/jvm/java-8-openjdk-amd64/include/linux/"

Answer 2

您需要使用JDK而不是JRE。 JDK包含JNI编译所需的库和头文件。

通常，您必须重新配置R并确保指向正确的Java安装。

看看这里：http://www.owsiak.org/?p=3671你可以在那里找到你必须采取的所有步骤的详细解释，以便让R正常使用Java。为macOS准备了解释，但它也适用于基于Linux的系统 - 几乎没有修改。

总结一下：

安装JDK

重新配置R

sudo R CMD javareconf \
JAVA_HOME=${JAVA_HOME} \
JAVA=${JAVA_HOME/bin/java \
JAVAC=${JAVA_HOME}/bin/javac \
JAVAH=${JAVA_HOME}/bin/javah \
JAR=${JAVA_HOME}/bin/jar \
JAVA_LD_LIBRARY_PATH=${JAVA_HOME}/jre/lib/server \
JAVA_CPPFLAGS="-I${JAVA_HOME}/include -I${JAVA_HOME}/include/linux"

启动R并安装需要Java的软件包

无法编译JNI程序来安装rJava包

2 个答案: