我收到此错误:
sum()得到了一个意想不到的关键字参数' out'
当我运行此代码时:
import pandas as pd, numpy as np
import keras
from keras.layers.core import Dense, Activation
from keras.models import Sequential
def AUC(y_true,y_pred):
not_y_pred=np.logical_not(y_pred)
y_int1=y_true*y_pred
y_int0=np.logical_not(y_true)*not_y_pred
TP=np.sum(y_pred*y_int1)
FP=np.sum(y_pred)-TP
TN=np.sum(not_y_pred*y_int0)
FN=np.sum(not_y_pred)-TN
TPR=np.float(TP)/(TP+FN)
FPR=np.float(FP)/(FP+TN)
return((1+TPR-FPR)/2)
# Input datasets
train_df = pd.DataFrame(np.random.rand(91,1000))
train_df.iloc[:,-2]=(train_df.iloc[:,-2]>0.8)*1
model = Sequential()
model.add(Dense(output_dim=60, input_dim=91, init="glorot_uniform"))
model.add(Activation("sigmoid"))
model.add(Dense(output_dim=1, input_dim=60, init="glorot_uniform"))
model.add(Activation("sigmoid"))
model.compile(optimizer='rmsprop',loss='binary_crossentropy',metrics=[AUC])
train_df.iloc[:,-1]=np.ones(train_df.shape[0]) #bias
X=train_df.iloc[:,:-1].values
Y=train_df.iloc[:,-1].values
print X.shape,Y.shape
model.fit(X, Y, batch_size=50,show_accuracy = False, verbose = 1)
除了批量循环和编辑源代码之外,是否可以实现自定义指标?
答案 0 :(得分:13)
我在回答OP的主题问题,而不是他的确切问题。我正在这样做,因为当我讨论主题问题时问题出现在顶部。
您可以通过两种方式实施自定义指标。
正如Keras docu中所述。
import keras.backend as K
def mean_pred(y_true, y_pred):
return K.mean(y_pred)
model.compile(optimizer='sgd',
loss='binary_crossentropy',
metrics=['accuracy', mean_pred])
但是在这里你必须记住MarcinMożejko的回答中提到y_true
和y_pred
是张量。因此,为了正确计算指标,您需要使用keras.backend
功能。有关详细信息How to calculate F1 Macro in Keras?
或者您可以按照Keras GH issue中提到的hacky方式实现它。为此,您需要使用callbacks
的{{1}}参数。
model.fit
答案 1 :(得分:9)
此代码不起作用,因为y_pred
和y_true
不是numpy数组,而是Theano或Tensor Flow张量。这就是你犯这个错误的原因。
您可以定义自定义指标,但必须记住它的参数是那些Tensors - 而不是numpy数组。
答案 2 :(得分:4)
您可以在AUC指标函数中传递model.predict()。 [这将迭代bacthes所以你可能最好使用model.predict_on_batch()。假设你有类似softmax图层的东西作为输出(输出概率的东西),那么你可以将它与sklearn.metric一起使用来获得AUC。
from sklearn.metrics import roc_curve, auc
来自here
def sklearnAUC(test_labels,test_prediction):
n_classes = 2
# Compute ROC curve and ROC area for each class
fpr = dict()
tpr = dict()
roc_auc = dict()
for i in range(n_classes):
# ( actual labels, predicted probabilities )
fpr[i], tpr[i], _ = roc_curve(test_labels[:, i], test_prediction[:, i])
roc_auc[i] = auc(fpr[i], tpr[i])
return round(roc_auc[0],3) , round(roc_auc[1],3)
现在制定您的指标
# gives a numpy array like so [ [0.3,0.7] , [0.2,0.8] ....]
Y_pred = model.predict_on_batch ( X_test )
# Y_test looks something like [ [0,1] , [1,0] .... ]
# auc1 and auc2 should be equal
auc1 , auc2 = sklearnAUC( Y_test , Y_pred )