Question

我正在尝试将包含字符串（50个字符串）的List与包含字符串的列表进行匹配，这些字符串是上一个列表中某些字符串的一部分（5个字符串）。我将发布完整的代码以提供下面的上下文，但我也想举一个简短的例子：

List1 = ['abcd12', 'efgh34', 'ijkl56', 'mnop78']

List2 = ['abc', 'ijk']

我想返回List1中匹配List2的字符串列表。我试图用set.intersection做一些事情，但似乎你不能与它做部分匹配（或者我不能用我有限的能力）。我也试过了any()，但我没有成功使它与我的列表一起工作。在我的书中它说我应该使用嵌套循环，但我不知道我应该使用哪个函数以及如何使用列表。

以下是完整的代码作为参考：

#!/usr/bin/env python3.4
# -*- coding: utf-8 -*-

import random

def generateSequences (n):

    L = []
    dna = ["A","G","C","T"]
    for i in range(int(n)):

        random_sequence=''

        for i in range(50):
            random_sequence+=random.choice(dna)

        L.append(random_sequence)

    print(L)
    return L

def generatePrefixes (p, L):

    S = [x[:20] for x in L]
    D = []
    for i in range(p):
        randomPrefix = random.choice(S)
        D.append(randomPrefix)

    return S, D

if __name__ == "__main__":
    L = generateSequences(15)
    print (L)
    S, D = generatePrefixes(5, L)
    print (S)
    print (D)

编辑：因为这被标记为可能的副本我想编辑这个以便说在这篇文章中使用python而另一个是用于R.我不知道R和是否有任何相似之处但乍一看它对我来说并不像。很抱歉给您带来不便。

Answer 1

使用嵌套for循环：

def intersect(List1, List2):
    # empty list for values that match
    ret = []
    for i in List2:
        for j in List1:
            if i in j:
                ret.append(j)
    return ret

List1 = ['abcd12', 'efgh34', 'ijkl56', 'mnop78']
List2 = ['abc', 'ijk']
print(intersect(List1, List2))

Answer 2

这可能不是最有效的方式，但它有效

matches = []

for seq_1 in List1:
    for seq_2 in List2:
        if seq_1 in seq_2 or seq_2 in seq_1:
            matches.append(seq_1)
        continue

Answer 3

尝试

[l1 for l1 in List1 if any([l2 in l1 for l2 in List2])]

Answer 4

您可以只比较字符串，我从list1中删除包含list2项的结果列表中的任何重复项。这基本上是你想要的：

f = []
for i in list1:
  for j in list2:
    if j in i:
      f.append(i)
result = list(set(f))

将两个部分匹配的字符串列表匹配到另一个列表中

4 个答案: