我创建了一个有1000条边的igraph。我的目标是提取在该igraph中找到的所有三角形,但包括标签而不仅仅是那个数字。我还希望它是一个数据框形式,有3列(三角形的每个节点一个)
我试过简单地打电话:
triangles(graph)
然后给出一个列表,其中所有名称都在一列中:
+ 28431/204 vertices, named:
[1] node_a
[2] node_b
[3] node_c
[4] node_a
[5] node_b
[6] node_d
[7] node_a
[8] node_b
[9] node_e
[10] node_a
+ ... omitted several vertices
当我尝试:
adjacent.triangles(graph)
它返回所有数字,但不返回节点的名称:
[1] 15 103 45 121 152 78 325 325 3 35 90 0 488 283 3 0 325 325 325 325 78 21 190 3
[25] 133 0 47 167 167 6 3 325 505 415 0 36 78 325 78 78 90 6 206 6 36 0 78 49
我需要通过igraph找到一个函数,它可以给我以下列格式的三角形:
COL1 COL2 COL3
node_a node_b node_c
node_a node_b node_d
node_a node_b node_e
node_f node_g node_h
任何帮助都会很棒,谢谢!
答案 0 :(得分:7)
你可以使用clique函数(假设g是你的图形),
cl.tri=cliques(g,min=3,max=3)
找到大小为3(三角形)的派系,然后按
将它们组装成数据帧df<-lapply(cl.tri,function(x){V(g)$name[x]})
df2=data.frame(matrix(unlist(df),ncol=3,byrow=T))