我开发了一个R代码,需要计算相同多元回归模型(15个变量)的10000多倍。我需要为每个模型提取所获得的t统计量,仅用于一个自变量。我需要为每个模型申请一个Heteroskedasticity-Consistent Covariance Matrix Estimator,我正在使用White的估算器通过 coeftest 和 vcovHC 来做,但是我注意到这个操作增加了很多所需的模拟计算时间。因此我想知道是否有办法加速代码,因为我只需要第二个变量的t统计量。
作为一个例子,这是我在每次迭代时所做的一个玩具示例。
model <- lm(y ~ a + b + c, data=data)
model <- coeftest(model ,vcov.=vcovHC(model ,type="HC"))
t[i] <- summary(MUR)$coef[2,3]
答案 0 :(得分:0)
使用hccm
包中的car
函数,然后直接提取 t 值,可以减少约30%的处理异方差校正的协方差矩阵。请参见下面的模拟:
library(lmtest)
library(sandwich)
library(microbenchmark)
library(ggplot2)
library(car)
microbenchmark(
hccm = {
m <- lm(cty ~ displ + cyl, data = mpg)
V <- hccm(m, "hc0")
cfs <- m$coefficients
ses <- sqrt(diag(V))
cfs / ses
},
coeftest = {
m <- lm(cty ~ displ + cyl, data = mpg)
coeftest(m, vcov. = vcovHC(m, type = "HC0"))
}
)
输出:
Unit: milliseconds
expr min lq mean median uq max neval cld
hccm 1.695146 1.777919 1.939631 1.822293 1.891840 10.65045 100 a
coeftest 2.557013 2.650025 2.735701 2.684586 2.764373 3.37536 100 b