R，覆盖/悬停摘要/工具提示中的交互式散点图作为用户提供的绘图函数

Question

我一直在研究R中的交互式图。我知道有几个软件包可以创建交互式图，特别是散点图，但我正在寻找某种功能。

例如this plot。可以将鼠标悬停在按钮上，以获得该点后面数据的小数字摘要，即工具提示。

当您拥有包含更多变量的数据集时，通常很容易从PCA中探索/可视化分数，或进行多维缩放（MDS）。但是，如果人们以交互方式绘制数据，如上面的例子，当一个人盘旋在点上时的摘要没有给出如此多的信息，即只是一长串的数字。能够生成要显示的自定义绘图会更好，而不仅仅是显示数值。

所以我的问题是：

当一个人盘旋在散点图中的某个点上时，是否有可能（在R中可用的某些包中）生成可视摘要。这可能是一个条形图，或者只是一些用户指定的绘图函数，它从data.frame中取一行作为参数。

如果可行的话，那将有助于快速了解MDS的结果。

修改

以下是在虹膜数据集上执行MDS的一些代码：

library(ggplot2)
library(plotly)
d <- dist(iris[,-5]) # euclidean distances between the rows
fit <- cmdscale(d,eig=TRUE, k=2) # k is the number of dim

# Put coordinates and original data in one data.frame
x <- fit$points[,1]
y <- fit$points[,2]
pDat <- data.frame(x=x,y=y)
pDat <- cbind(pDat,iris)
p <- ggplot(pDat) + geom_point(aes(x,y))
ggplotly(p)

首先，现在工具提示仅包含x，y坐标。我想工具提示包含原始4个变量的值。然后，我想将工具提示显示为条形图，而不是数据点后面的原始4个变量。 MDS保留了数据点之间的距离，因此可以用鼠标逐渐悬停，并且看到条形图几乎连续变化，因为距离得以保留。在我的使用案例中，每个点后面有30个变量，因此条形图摘要提供的视觉信息比30个数值更多。

Answer 1

如果您正在使用RStudio，那么情节包应该足够友好以供使用。 例如：

library(ggplot2)
library(plotly) 
p <- ggplot(iris, aes(Sepal.Length, Petal.Length, colour=Species)) + geom_point()
 ggplotly(p)

悬停在一个点上时显示的信息如下：

Answer 2

如果您使用rbokeh的最新开发版本，您可以通过以下方式实现目标：

devtools::install_github("bokeh/rbokeh@v0.6.3")

library(rbokeh)

iris$sw <- paste0(iris$Sepal.Width * 20, "px")
iris$pw <- paste0(iris$Petal.Width * 20, "px")
iris$sl <- paste0(iris$Sepal.Length * 20, "px")
iris$pl <- paste0(iris$Petal.Width * 20, "px")

style_str <- "white-space: nowrap; border: 1px solid white; background: steelblue; height: 15px;"

figure() %>%
  ly_points(x = Sepal.Width, y = Sepal.Length, color = Species,
  data = iris, hover = glue::glue("
<div>
  <div style='{style_str} width: @sw'>Sepal width</div>
  <div style='{style_str} width: @pw'>Petal Width</div>
  <div style='{style_str} width: @sl'>Sepal width</div>
  <div style='{style_str} width: @pl'>Petal Length</div>
</div>
"))

这里发生的是rbokeh允许你指定任意html作为工具提示，所以这里我们根据数据值（用@sw引用等）创建具有指定宽度的div，以创建条形图

上面的示例适用于简单的条形图，但如果您希望能够在工具提示中显示任意图像，则一种方法是为每个数据点预生成光栅图像并将其作为html工具提示嵌入（带有base64编码图像的img标记作为src）。