我试图访问Geometadb数据库,该数据库首先涉及下载SQL库。我做到了,然后我得到了Geometadb库。
library(GEOmetadb)
接下来我需要Geometadb文件,这是事情开始出错的地方。我发出此命令正如教程中所见:https://bioconductor.riken.jp/packages/3.0/bioc/vignettes/GEOmetadb/inst/doc/GEOmetadb.html
if(!file.exists('GEOmetadb.sqlite')) getSQLiteFile()
不仅要下载.gz zip文件,还要解压缩文件。它下载它但从不解压缩它。相反,我得到以下错误。
trying URL 'http://dl.dropbox.com/u/51653511/GEOmetadb.sqlite.gz'
Error in download.file(url_geo, destfile = localfile, mode = "wb") :
cannot open URL 'http://dl.dropbox.com/u/51653511/GEOmetadb.sqlite.gz'
In addition: Warning message:
In url(url_geo_2, open = "rb") :
cannot open: HTTP status was '403 Forbidden'
不确定这里发生了什么。考虑到这些只是早期的教程步骤,我可能错过了一些非常明显的东西,但我希望有人可以帮助我。谢谢!