Question

我试图用＃34;＆＃34;＆＃34;替换所有不是ACTG的字符。（空）使用gsub。这似乎不是出于某种原因。相反，我得到一个我不知道它代表什么的数字。以下是我尝试使用＆＃34;＆＃34;替换不同模式的一些示例： gsubexamples

谢谢！

Answer 1

欢迎使用Stack Overflow。将来，请提供一个可重复的示例，通常来自您的问题样本或示例问题，说明您的更大问题，其解决方案也适用于您更大的问题。

要保留ATGC字符，请在gsub()的字符组中使用否定：

txt <- "Junk|A|GATC|ATTG!getmeoutofhere!|AAABBCC"
gsub("[^GATC]", "", txt)
## [1] "AGATCATTGAAACC"

您需要在适当的时候将此应用于您的对象 - 如果没有示例，则无法准确地告诉您。