Question

我正在编写一个生物信息学工具，在设置后我想检查特定文件的某些路径。

我还有一些我希望打包到脚本中的cython代码。我目前正在使用setup.py和distutils进行编译

是否可以在我的setup.py中添加配置文件来检查四条路径？

我正在考虑像这样的.ini配置文件

[myScript_PATHS]
myScript = $CURRENT_WORKING_DIR # actually how do I do this? link to the working dir? 
fasta = /home/myName/reference/human/hg19.fasta
prepro = $CURRENT_WORKING_DIR/myScript_preprocessing
feats = $CURRENT_WORKING_DIR/myScript_features

因此，当用户下载并解压缩我的tarball时。用户将运行python setup.py

我如何确保以下内容：

我的cython .pyx文件是否已编译到位？
如果路径不存在则创建它们

谢谢！我是一名生物学家，所以我不熟悉打包脚本的这些细节。

Answer 1

一个答案 - 我的cython .pyx文件是否已编译到位？

使用distutil setup.cfg我把它放在文件

中

[build_ext]
inplace=1

Python配置文件：设置脚本的路径

1 个答案: