我试图找到使用apache spark在大量数据上搜索不相交集(连接组件/ union-find)的算法。 问题是数据量。甚至图顶点的Raw表示也不适合单机上的ram。边缘也不适合公羊。
源数据是hdfs上图形边缘的文本文件:“id1 \ t id2”。
id作为字符串值出现,而不是int。
我发现天真的解决方案是:
[id1:id2] [id3:id4] [id1:id3]
[id1:[id2;id3]][id3:[id4]]
(flatMap) [id1:id1][id2:id1][id3:id1][id3:id3][id4:id3]
[id2:id1] -> [id1:id2]
leftOuterJoin
来自第3阶段和第4阶段的rdds 但这会导致节点之间传输大量数据 (改组)
有任何建议吗?
答案 0 :(得分:0)
如果您正在使用图表,我建议您查看其中一个库
他们都提供开箱即用的连通组件算法。
<强> GraphX 强>:
val graph: Graph = ...
val cc = graph.connectedComponents().vertices
<强> GraphFrames 强>:
val graph: GraphFrame = ...
val cc = graph.connectedComponents.run()
cc.select("id", "component").orderBy("component").show()