无法使用php执行命令行

Question

我尝试为本地BLAST运行命令行。我已经下载了包并允许每个文件和文件夹的权限。但我仍然无法在我的页面上显示它的输出。

echo shell_exec("/opt/lampp/htdocs/blasto/bin/blastp -query /opt/lampp/htdocs/blasto/result/INF2dWxh -db /opt/lampp/htdocs/blasto/db/*.faa -evalue 10 ");

希望任何人都可以帮助我。

Answer 1

shell_exec只会返回STDOUT。除非您在命令末尾添加2>&1，否则写入STDERR的任何错误消息都将丢失。这会将写入STDERR（文件描述符＃2）的任何内容重定向到STDOUT（文件描述符＃1），它将由shell_exec返回并由echo显示。所以，试试这个......

echo shell_exec("/opt/lampp/htdocs/blasto/bin/blastp"
    . " -query /opt/lampp/htdocs/blasto/result/INF2dWxh"
    . " -db /opt/lampp/htdocs/blasto/db/*.faa"
    . " -evalue 10"
    . " 2>&1"
);