我有一个DataFrame,我将它映射到()的RDD以测试SVMModel。
我正在使用Zeppelin和Spark 1.6.1
这是我的代码:
val loadedSVMModel = SVMModel.load(sc, pathToSvmModel)
// Clear the default threshold.
loadedSVMModel.clearThreshold()
// Compute raw scores on the test set.
val scoreAndLabels = df.select($"features", $"label")
.map { case Row(features:Vector, label: Double) =>
val score = loadedSVMModel.predict(features)
(score,label)
}
// Get evaluation metrics.
val metrics = new BinaryClassificationMetrics(scoreAndLabels)
val auROC = metrics.areaUnderROC()
println("Area under ROC = " + auROC)
执行代码时,我有一个org.apache.spark.SparkException: Task not serializable;
,我很难理解为什么会发生这种情况,我该如何解决。
我已经在Spark编程指南中执行了SVM example,它运行得很好。所以原因应该与上面的一点相关......我猜。
以下是Exception堆栈的一些相关元素:
Caused by: java.io.NotSerializableException: org.apache.spark.sql.Column
Serialization stack:
- object not serializable (class: org.apache.spark.sql.Column, value: (sum(CASE WHEN (domainIndex = 0) THEN sumOfScores ELSE 0),mode=Complete,isDistinct=false) AS 0#100278)
- element of array (index: 0)
- array (class [Lorg.apache.spark.sql.Column;, size 372)
我没有发布完整的异常堆栈,因为Zeppelin倾向于显示非常长的不相关文本。如果您希望我通过完整的例外,请告诉我。
其他信息
使用VectorAssembler()生成特征向量,如下所示
// Prepare vector assemble
val vecAssembler = new VectorAssembler()
.setInputCols(arrayOfIndices)
.setOutputCol("features")
// Aggregation expressions
val exprs = arrayOfIndices
.map(c => sum(when($"domainIndex" === c, $"sumOfScores")
.otherwise(lit(0))).alias(c))
val df = vecAssembler
.transform(anotherDF.groupBy($"userID", $"val")
.agg(exprs.head, exprs.tail: _*))
.select($"userID", $"features", $"val")
.withColumn("label", sqlCreateLabelValue($"val"))
.drop($"val").drop($"userID")
答案 0 :(得分:6)
问题的根源实际上与您使用的DataFrame
无关,甚至与Zeppelin直接相关。更多的是代码组织与在同一范围内存在非可序列化对象的问题。
由于您使用交互式会话,因此所有对象都在同一范围内定义,并成为闭包的一部分。它包含exprs
,其Seq[Column]
看起来像Column
,exprs
不可序列化。
操作SQL表达式时不会出现问题,因为RDD
仅在本地使用,但在下拉到exprs
操作时会出现问题。 ColumnName
作为闭包的一部分包含在内,并导致表达式。您可以重现此行为的最简单方法(Column
是Welcome to
____ __
/ __/__ ___ _____/ /__
_\ \/ _ \/ _ `/ __/ '_/
/___/ .__/\_,_/_/ /_/\_\ version 2.0.0-SNAPSHOT
/_/
Using Scala version 2.11.8 (OpenJDK 64-Bit Server VM, Java 1.8.0_91)
Type in expressions to have them evaluated.
Type :help for more information.
scala> val df = Seq(1, 2, 3).toDF("x")
df: org.apache.spark.sql.DataFrame = [x: int]
scala> val x = $"x"
x: org.apache.spark.sql.ColumnName = x
scala> def f(x: Any) = 0
f: (x: Any)Int
scala> df.select(x).rdd.map(f _)
org.apache.spark.SparkException: Task not serializable
...
Caused by: java.io.NotSerializableException: org.apache.spark.sql.ColumnName
Serialization stack:
- object not serializable (class: org.apache.spark.sql.ColumnName, value: x)
...
)的子类是这样的:
exprs
您可以尝试解决此问题的一种方法是将@transient val exprs: Seq[Column] = ???
标记为瞬态:
scala> @transient val x = $"x"
x: org.apache.spark.sql.ColumnName = x
scala> df.select(x).rdd.map(f _)
res1: org.apache.spark.rdd.RDD[Int] = MapPartitionsRDD[8] at map at <console>:30
在我们的最小例子中也可以正常工作:
foo.click() += some_other_function; // supposedly to invoke another function
// when the foo HTML element is clicked.