确保shell脚本仅作为lsf作业执行

时间:2016-05-13 05:17:07

标签: shell lsf

我有shell脚本,并希望将其作为正常作业禁用。它应该仅作为LSF中的bjob执行

如何在脚本

中确保这一点

3 个答案:

答案 0 :(得分:2)

lsfError="**ERROR: Local jobs disabled. Please run through LSF only --"
lsfExit=2
lsfLog="$(getent passwd $(id -un) | cut -d: -f6)/.lsbatch/.lsf_${LSB_JOBID}.log"
echo "**INFO: Verifying as LSF job ..."
sleep 2s
if [ -z "$LSB_JOBID" ]; then
  echo "$lsfError"; exit $lsfExit
elif [[ "$(bjobs $LSB_JOBID 2>&1)" =~ "not found" ]]; then
  echo "**ERROR: Job $LSB_JOBID doesn't exist" > $lsfLog
  echo "$lsfError"; exit $lsfExit
elif [[ "$(bjobs -o 'command' -noheader $LSB_JOBID 2>&1)" != "$0" ]]; then
  echo "**ERROR: Command not matched $(bjobs -o "command" -noheader $LSB_JOBID 2>&1) != $0" > $lsfLog
  echo "$lsfError"; exit $lsfExit
fi

答案 1 :(得分:0)

LSF将在作业环境中设置一些环境变量,例如$LSB_JOBID。您可以编写脚本来检查是否已定义此环境变量。如果没有,请解释该脚本应仅作为LSF作业运行,然后退出。

答案 2 :(得分:0)

我猜您可以期望res启动LSF作业,因此您可以检查同一进程组中是否存在res进程,例如

_pgid=`ps -o pgid --no-headers -p $$`
ps -o comm,pgid --no-headers | grep -qE '^res\s+'${_pgid// /}'$' || { echo "Must submit as LSF job!"; exit 1; }