ReadAffy()太长了

时间:2016-05-12 18:31:02

标签: r rstudio packages terminate

我在Ubuntu 14.04上的R 3.3.0上使用Rstudio并成功安装了包Affy

但是,当我设置CEL文件所在的目录(使用setwd())并给出命令cel1 <- ReadAffy()时,没有输出。我甚至没有使用>进入下一行。它根本不显示任何输出。

此外,Ctrl+CEsc也没有停止此过程。通常Esc用于停止我系统上的进程。以下是屏幕截图:Screenshot of the problem

此外,当我尝试退出会话时,响应时间太长。是什么导致了这个问题,我该如何解决?

编辑: 我在文件夹中只有3个CEL个文件。

编辑#2:编辑#2: 我也将它应用于单个文件,但需要花费太多时间。系统监控截图: enter image description here 它占用了大量CPU和大量内存(以GB为单位)。是什么导致了这个问题?我正在使用一个简单的命令ReadAffy(filenames = "N54.CEL")。为什么会导致问题?任何建议都会有所帮助。绝望的在这里。

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

原来文件本身存在一些问题。我从不同的来源获得了文件,并且工作正常。