如何基于R中的相同列合并/匹配两个文件

Question

我有两个文件：

1. 第一个文件是带有标题（file1$sample）的单列文件，包含200个样本/行。

2. 第二个是多列和多行：

   dim(file2) 
   #[1] 652 20206  
   

我想匹配file1 $ sample和file2 $ sample并提取矩阵 （200 * 20206）。

我尝试了以下命令：

new <- merge(file1, file2, by.x='sample', by.y='sample') 

但仅提供单行文件

dim(new) 
#[1] 0 20206

所以请帮助我如何提取（200 * 20206）矩阵。

由于

Answer 1

试试这个：

file1 = read.table("mydata1.txt", header=TRUE)
file2 = read.table("mydata2.txt", header=TRUE)
m=merge(file1,file2,by="sample")

Answer 2

试试这个：

result=merge(x=file1,y=file2,by="sample",all=T)