打开MPI + Scalasca:无法使用选项--pre

时间:2016-05-09 08:03:45

标签: mpi openmpi hpc

我已安装scalasca(scorep,cube,..)和Open MPI进行性能测量。当我添加一个选项: " --prefix = / my-path"到了mpirun," scalasca - 分析"无法执行(已中止)。
我的命令:
scalasca -analyze mpirun -np 1 --host localhost --prefix /home/as/lib/bin /home/as/Documents/a.out
" /家/ AS / LIB"是已安装的Open MPI目录 并且错误:
S=C=A=N: Abort: Target executable /家/ AS / LIB /仓'是一个目录!` 如果没有" - 前缀"它运行正常。但我需要" - 前缀"在群集上运行它的选项 我在所有具有相同路径的集群机器上安装了Open MPI(/ home / as / lib) 那么如何解决呢???

1 个答案:

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如果使用完整路径调用--prefix(或其orterunmpirun等任何符号链接),则打开MPI会添加隐式mpiexec选项。换句话说:

$ /home/as/lib/bin/mpirun ...

相当于:

$ mpirun --prefix /home/as/lib ...

如果您真的需要通过--prefix选项,例如因为Open MPI安装在与前端节点不同的目录中的集群节点上,然后引用整个参数:

$ scalasca -a mpirun -np 1 --host localhost "--prefix /home/as/lib" /path/to/execuable

同样适用于mpirun的任何其他参数。你甚至可以引用它们,只是为了安全起见:

$ scalasca -a mpirun "-np 1" "--host localhost" "--prefix /home/as/lib" /path/to/execuable

提示:构建自己的Open MPI版本时,请使用--enable-orterun-prefix-by-default。即使未使用完整路径调用--prefix / orterun / mpirun,也会自动添加mpiexec。此外,--enable-wrapper-rpath是构建选项的不错选择,它可以防止与库的其他版本发生冲突。