我已将GEE应用于以下数据集(str如下)。一切都很好。
> str(cd4.5m2)
'data.frame': 1300 obs. of 7 variables:
$ id : Factor w/ 260 levels "1","5","29","32",..: 1 1 1 1 1 2 2 2 2 2 ...
$ Treatment: Factor w/ 4 levels "Alternating",..: 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 ...
$ Age : num 36.4 36.4 36.4 36.4 36.4 ...
$ Gender : Factor w/ 2 levels "Female","Male": 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 ...
$ logcd4 : num 3.14 3.04 2.77 2.83 3.22 ...
$ Week : num 0 7.57 15.57 23.57 32.57 ...
$ Time : int 0 1 2 3 4 0 1 2 3 4 ...
然后我转换了结果变量,原因是我们想要监控随时间的变化。因此,转换后的数据的str看起来如下所示,几乎与前一个数据完全相同(除了一些名称更改)。
> str(cd4.5m1)
'data.frame': 1300 obs. of 6 variables:
$ id : Factor w/ 260 levels "1","5","29","32",..: 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ...
$ Treatment : Factor w/ 4 levels "Alternating",..: 2 1 4 1 3 3 1 4 1 3 ...
$ Age : num 36.4 35.9 47.5 37.3 42.7 ...
$ Gender : Factor w/ 2 levels "Female","Male": 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 ...
$ Week : num 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
$ cd4.change.norm: num 0.572 0.572 0.572 0.572 0.572 ...
然后我再次运行GEE,它给了我错误。
> gee1.default <- geeglm(cd4.change.norm ~ Treatment, data=cd4.5m1, id=id, family=gaussian, corstr="unstructured")
Error in `contrasts<-`(`*tmp*`, value = contr.funs[1 + isOF[nn]]) :
contrasts can be applied only to factors with 2 or more levels
我还测试了数据中的所有变量,它们都包含多个值。所以我完全迷失在这里。我也看到了很多关于此错误的帖子,但似乎没有人能够在这里解决我的问题。帮助赞赏!
答案 0 :(得分:1)
我将相关结构更改为AR1,并且工作正常。我测试了相关性(随时间减少),AR1是正确的结构。
但通常非结构化应该是保存选项吗?